miRNA與疾病關(guān)聯(lián)關(guān)系的計(jì)算模型
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microRNAs（miRNAs）在生命進(jìn)程中發(fā)揮著重要作用．近年來(lái)，預(yù)測(cè)miRNAs與疾病的關(guān)聯(lián)關(guān)系成為一個(gè)研究熱點(diǎn)．當(dāng)前，計(jì)算方法整體上可以分為兩大類：基于相似度度量的方法和基于機(jī)器學(xué)習(xí)的方法．前者通過(guò)度量網(wǎng)絡(luò)中節(jié)點(diǎn)之間的關(guān)聯(lián)強(qiáng)度預(yù)測(cè)miRNA-疾病關(guān)聯(lián)。但需要構(gòu)建高質(zhì)量的生物網(wǎng)絡(luò)模型：后者將機(jī)器學(xué)習(xí)相關(guān)算法應(yīng)用到這個(gè)問(wèn)題中，但需要構(gòu)建高可信度的負(fù)例集合，基于以上困難和不足，提出了一種計(jì)算模型BNPDCMDA，用于預(yù)測(cè)miRNAs-疾病關(guān)聯(lián)關(guān)系．該方法首先構(gòu)建miRNA-疾病雙層網(wǎng)絡(luò)模型。然后利用miRNA的功能相似度對(duì)其進(jìn)行基于密度的聚類，進(jìn)而將二分網(wǎng)絡(luò)投影應(yīng)用于聚類后的miRNAs及疾病集合構(gòu)成的miRNA-疾病雙層子網(wǎng)中，最終完成對(duì)miRNA與疾病關(guān)聯(lián)關(guān)系的預(yù)測(cè)．實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明。采用留一交叉驗(yàn)證法得到的AUC值可達(dá)99.08%。明顯優(yōu)于當(dāng)前其他高效方法．最后。采用BNPDCMDA方法對(duì)某些常見疾病所關(guān)聯(lián)的miRNAs進(jìn)行預(yù)測(cè)。實(shí)驗(yàn)結(jié)果獲得了文獻(xiàn)的支持，進(jìn)一步表明了該方法的有效性。
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