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一種新工具,可對環(huán)狀DNA進行測序

MEMS ? 來源:MEMS ? 2020-06-01 16:14 ? 次閱讀
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據(jù)麥姆斯咨詢介紹,加拿大阿爾伯塔大學(University of Alberta)生物學家發(fā)明了一種新工具,可對環(huán)狀DNA進行測序,這將為科學家提供更豐富、更準確的數(shù)據(jù),有望促進針對病毒、農(nóng)業(yè)甚至癌癥的研究。

這一工具名為“CIDER-Seq”,它使用了被稱為“PacBio”的DNA測序技術(shù),研究人員目前已將其發(fā)表在網(wǎng)絡(luò)上,供其他科學家分析DNA序列。

研究主要作者、博士后研究員Devang Mehta說:“借助CIDER-Seq,我們可以了解神秘的環(huán)狀DNA在人和植物細胞中的功能?!?/p>

研究人員解釋稱,環(huán)狀DNA在細菌和病毒的基因組中很常見,最近,科學家又在人和植物細胞的核內(nèi)發(fā)現(xiàn)了環(huán)狀DNA,并將其稱為染色體外環(huán)狀DNA(eccDNA)。這種鮮為人知的環(huán)狀DNA也常出現(xiàn)在癌細胞中,甚至可能與其快速繁殖的能力有關(guān)。

研究人員此前已開始著手調(diào)查eccDNA在癌癥中的作用,但由于缺乏有效的研究和測序方法,此類研究進展緩慢。

Mehta表示:“鑒于此,我們設(shè)計了一種新的分子生物學方法和新的生物信息學算法,以最終獲得eccDNA的完整序列。我們的方法能對這些分子進行完整測序,并為我們和其他研究人員提供一種新工具,可以更好地了解它們在細胞中的實際作用。”

Mehta指出,新工具可能對農(nóng)業(yè)科學家特別有用,因為許多農(nóng)作物感染的病毒都擁有環(huán)狀DNA。他舉例說:“在肯尼亞的一次田間試驗中,我們使用CIDER-Seq的早期版本,幫助研究了經(jīng)過基因工程改造的農(nóng)作物在對抗環(huán)狀DNA病毒方面的有效性。”

聲明:本文內(nèi)容及配圖由入駐作者撰寫或者入駐合作網(wǎng)站授權(quán)轉(zhuǎn)載。文章觀點僅代表作者本人,不代表電子發(fā)燒友網(wǎng)立場。文章及其配圖僅供工程師學習之用,如有內(nèi)容侵權(quán)或者其他違規(guī)問題,請聯(lián)系本站處理。 舉報投訴
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原文標題:環(huán)狀DNA測序工具面世,有望促進農(nóng)業(yè)和癌癥等領(lǐng)域的研究

文章出處:【微信號:MEMSensor,微信公眾號:MEMS】歡迎添加關(guān)注!文章轉(zhuǎn)載請注明出處。

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