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電子發(fā)燒友網(wǎng)>電子資料下載>嵌入式開發(fā)>MPI集群通信機制的設計方案解析

MPI集群通信機制的設計方案解析

2017-10-21 | rar | 0.6 MB | 次下載 | 1積分

資料介紹

  在集群計算系統(tǒng)中,隨著系統(tǒng)規(guī)模的增大,通信效率是影響整個系統(tǒng)獲得高性能的關鍵因素之一。而隨著局域網(wǎng)傳輸性能的快速提高,Myrinet、Gigabit Ethernet和Infiniband等千兆位網(wǎng)絡設備已被廣泛使用,當前影響集群節(jié)點間通信性能的瓶頸已經(jīng)從通信硬件的傳送開銷轉(zhuǎn)移到了通信處理軟件的開銷上,所以采用優(yōu)化的通信協(xié)議是降低通信成本、提高結(jié)點間通信的有效手段。
  在當前的集群通信應用中,普遍采用兩類通信結(jié)構(gòu),即核心級通信和用戶級通信。但由于它們設計的初衷并非是針對集群通信,所以并不適合當前集群環(huán)境的特點。為此,本文通過分析這兩類通信結(jié)構(gòu)的特點,提出了以核心級通信為基礎,旁路內(nèi)核中IP層及以上協(xié)議層,實現(xiàn)數(shù)據(jù)鏈路層直接與MPI通道接口層通信的新機制,并通過實驗驗證,為傳統(tǒng)集群的升級改造提供一種新的無連接、無差錯控制,開銷小、延時低的通信機制。
  1 基于數(shù)據(jù)鏈路層的集群通信結(jié)構(gòu)的提出
  目前各種通信協(xié)議普遍采用兩種通信結(jié)構(gòu),即核心級通信和用戶級通信[1]。
  1.1 核心級通信
  在核心級通信中,操作系統(tǒng)內(nèi)核控制著所有消息傳遞中的發(fā)送與接收處理,并且負責它們的緩沖管理和通信協(xié)議的實現(xiàn),設備驅(qū)動程序也是通過內(nèi)核來完成所有的硬件支持與協(xié)議軟件處理的任務,如圖1所示。在通信過程中,系統(tǒng)要經(jīng)過多次內(nèi)核態(tài)與用戶態(tài)之間的數(shù)據(jù)拷貝才能夠?qū)崿F(xiàn)數(shù)據(jù)的傳送。有數(shù)據(jù)表明[2],一般奔騰處理器的內(nèi)存拷貝速率平均為70 Mb/s,但是由于操作系統(tǒng)在交換頁面時的 I/O 數(shù)據(jù)傳送都是阻塞操作,若出現(xiàn)缺頁中斷,其時延將會更大,所以頻繁的內(nèi)存拷貝操作的開銷將是影響整體性能的瓶頸所在。因此,對于通信效率要求較高的集群計算系統(tǒng),核心級通信是不適合的。
  MPI集群通信機制的設計方案解析
  1.2 用戶級通信
  在用戶級通信中,操作系統(tǒng)內(nèi)核將網(wǎng)絡接口控制器NIC(Network Interface Controller)的寄存器和存儲器映射到用戶地址空間,允許用戶進程旁路操作系統(tǒng)內(nèi)核從直接訪問NIC,直接將數(shù)據(jù)從用戶空間發(fā)送到網(wǎng)絡中進行傳輸。通信事件處理的觸發(fā)采用查詢方式而不是中斷方式,由于旁路操作系統(tǒng)內(nèi)核,使得整個通信過程省掉了執(zhí)行系統(tǒng)調(diào)用、用戶態(tài)與核心態(tài)之間的數(shù)據(jù)拷貝及用戶與內(nèi)核的上下文切換等軟件上的開銷,進而減少對主機CPU資源的占用,縮短通信操作的關鍵路徑,實現(xiàn)通信與計算的重疊。如圖2所示[3]。
  MPI集群通信機制的設計方案解析
  但是,采用用戶級通信協(xié)議時,通信過程中的所有操作均在用戶空間中進行,當用戶程序出錯或有惡意用戶進行破壞時,系統(tǒng)就很容易被破壞。這是因為系統(tǒng)數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)中不僅包含本進程(或并行任務)及其相關信息,同時也包含與本進程無關的其他進程(或并行任務)的相關信息。若某一用戶(并行任務)出錯或失誤,都將會影響到其他用戶(并行任務)的執(zhí)行,因而很難保證系統(tǒng)的安全性和可靠性,也無法保證并行任務間的相互獨立性。
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