DNA甲基化是一種可遺傳、可逆轉(zhuǎn)的表觀遺傳學(xué)特征，不同基因的甲基化程度，對基因表達(dá)有不同的抑制作用。3月21日，記者從南京醫(yī)科大學(xué)獲悉，該校公共衛(wèi)生學(xué)院陳峰教授課題組采用數(shù)據(jù)挖掘的統(tǒng)計分析手段，構(gòu)建了基于生物標(biāo)記物的肺癌預(yù)后預(yù)測模型，對患者生存時間的預(yù)測精度高達(dá)89%。研究結(jié)果在獨(dú)立人群中得到驗證，為肺癌風(fēng)險評估與精準(zhǔn)治療提供了有力證據(jù)。該成果近日發(fā)表于國際著名期刊《胸科》。

不同預(yù)后評分人群的K-M生存曲線及預(yù)測模型的ROC曲線，課題組供圖

肺癌位居惡性腫瘤死因首位，根據(jù)患者的遺傳特征，利用有效的生物標(biāo)記物進(jìn)行個體化風(fēng)險評估，可以為病情發(fā)展提供判斷依據(jù)。而DNA甲基化就可作為一種生物標(biāo)記物。

自2015年起，南京醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院陳峰教授課題組，便聚焦早期非小細(xì)胞肺癌預(yù)后的表觀基因組學(xué)研究，并與美國哈佛大學(xué)、西班牙巴塞羅那大學(xué)、挪威奧斯陸大學(xué)、瑞典隆德大學(xué)開展國際合作研究。

論文的作者之一、南京醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院張汝陽副教授介紹，團(tuán)隊利用合作者的現(xiàn)有實驗室數(shù)據(jù)和公共數(shù)據(jù)，從表觀基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)出發(fā)，對38萬個基因指標(biāo)進(jìn)行分析，篩選具有主效應(yīng)、交互效應(yīng)的生物標(biāo)記物，結(jié)合人口學(xué)、臨床指標(biāo)，最終構(gòu)建基于生物標(biāo)記物的肺癌預(yù)后預(yù)測模型。

“此前人們并不了解到底有哪些基因的甲基化水平會影響肺癌患者的生存時間，我們從38萬個基因指標(biāo)中發(fā)現(xiàn)，50多個基因甲基化和基因表達(dá)的生物標(biāo)記物，會影響肺癌患者的生存時間。針對肺癌患者3年、5年存活率的預(yù)測精度，可分別達(dá)到88%和89%。根據(jù)目前的研究發(fā)現(xiàn)，這個模型是早期非小細(xì)胞肺癌預(yù)后預(yù)測精度最高的模型，將為早期肺癌臨床決策與治療提供參考?！睆埲觋栒f。