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軌道靜電能OEE模型示意圖講解

lhl545545 ? 來源:知社學術圈 ? 作者:知社學術圈 ? 2020-06-18 15:20 ? 次閱讀
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目前普遍認為,離子-π相互作用由靜電效應和極化效應共同主導。因而,在描述離子-π相互作用時,常常用靜電勢(ESP)或四極矩(Qzz)來描述靜電效應,并利用分子極化率(azz)來描述極化效應。然而,這些模型(如ESP、Qzz和azz)存在一個不足:它們將離子視為點電荷,因而無法區(qū)分和識別離子的信息。然而在生命活動中,離子(如神經遞質乙酰膽堿)中通常攜帶著重要的信息。

軌道靜電能OEE模型示意圖 最近,復旦大學研究團隊(劉章云博士生、陳征博士、奚晉楊博士以及徐昕教授)在《國家科學評論》(National Science Review,NSR) 發(fā)表研究論文,提出了描述靜電效應的新概念——軌道靜電能OEE,該模型同時考慮離子和芳香π體系雙方的軌道細節(jié),可以精確地刻畫靜電相互作用(如上圖)。當離子簡化為點電荷時,OEE模型自然地簡化為ESP模型;而Qzz是ESP模型的進一步簡化。利用其課題組開發(fā)的高精度、高效率的XYG3新泛函,作者構建了一個接近CC精度的離子-π復合物結合能數(shù)據(jù)集(耦合簇(CC)是一種用于非鍵相互作用結合能計算的高級計算方法)。該數(shù)據(jù)集包含了苯環(huán)及氮雜環(huán)的各種取代物與簡單球型離子(如Na+和Cl-)及復雜結構離子(如NH4+, C(NH2)3+,N3-, NO3-, BF4-,SCN-)等的各種相互作用。顯然,對于簡單球型離子,點電荷近似可以是一個較好的近似;而對于復雜結構離子,點電荷近似就會相形見絀了。要研究相互作用的本質,理論上可以對相互作用能進行仔細的能量分解。但是,這需要進行反復的各種限制條件下的(變分)計算,不僅耗時,而且可能失敗,不適合于大量數(shù)據(jù)的研究。另一方面,在實際應用中,人們往往更關注變化趨勢,希望能夠從大量數(shù)據(jù)中抽提出有用的定性概念,并要求計算過程精確、簡單、便于定量化和推理化。為達到這一目標,作者設計了一系列具有定性或定量差異的描述子,希望能從中篩選出可用于離子-π相互作用體系篩選或設計的描述子。結果發(fā)現(xiàn),當一個描述子包含越精確的靜電效應,其與總結合能的關聯(lián)就會越強。無論何種形狀的離子與芳香烴相互作用,需要且僅需要一個OEE描述子就能夠始終很好地關聯(lián)各類結合能(如下圖)。

(a) BF4--π復合物結合能(BE)與靜電勢(ESP)的關聯(lián),其中ESP數(shù)值取自環(huán)中心范德華面上(電子密度為0.001 a.u.)靜電勢;(b) BF4--π復合物結合能(BE)與軌道靜電(OEE)的關聯(lián)。值得強調的是,OEE不是一個相互作用能的全部,有時它甚至不是該相互作用能的最主要貢獻項,但卻能夠精準描述出一類離子-π相互作用的變化趨勢?;诖诵吕斫?,作者還提出了一種方法,可以利用低精度方法下得到的OEE來預測高精度結合能。相比于目前同時考慮靜電和極化效應的離子-π結合能預測方法,OEE模型更精準、更簡明。OEE模型在描述陰離子-π相互作用和復雜結構離子-π相互作用中優(yōu)勢顯著。定性上,作者提出了軌道靜電的概念,同時考慮離子和芳香π體系雙方的軌道細節(jié),從而超越了既有模型,可以更精確刻畫靜電相互作用。定量上,作者發(fā)現(xiàn)需要且僅需要一個OEE描述子就能定量預測離子-π結合能的變化趨勢。靜電相互作用在諸多非共價相互作用中均非常重要,因此,OEE作為一個有精確定義、方便計算的新描述子,有望成為超分子化學和生物化學領域中另一個強有力的工具。
責任編輯:pj

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    利于中文讀者理解的目標,做了刪減、重構和意譯,并替換了多張不適合中文讀者的示意圖。 原文地址:https://magazine.sebastianraschka.com/p
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