為了檢測引起新冠病毒肺炎(COVID-19)的SARS-CoV-2病毒,Oxford Nanopore Technologies公司正在著手開發(fā)一種快速且低成本的檢測。目前,這種名為LamPORE的檢測已進(jìn)入開發(fā)的后期階段。
LamPORE檢測是基于Oxford Nanopore的DNA/RNA測序技術(shù),而樣本制備則采用了環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增(LAMP)技術(shù)以及Oxford Nanopore的快速建庫試劑盒。它能夠檢測樣本中是否含有SARS-CoV-2病毒。
自從SARS-CoV-2病毒出現(xiàn)以來,Oxford Nanopore的快速便攜式測序技術(shù)已大量用于COVID-19的流行病學(xué)和科學(xué)研究。LamPORE是該公司內(nèi)部開發(fā)的首個(gè)檢測產(chǎn)品,可在GridION或MinION測序設(shè)備上運(yùn)行。
LAMP技術(shù)本身已被用于病毒的檢測,可根據(jù)顏色來判斷結(jié)果,但在大規(guī)模運(yùn)行時(shí)基于顏色的結(jié)果判斷頗具挑戰(zhàn)性。LamPORE將成熟的LAMP方法與Oxford Nanopore測序技術(shù)相結(jié)合,可獲得精確的數(shù)字結(jié)果。同時(shí),這項(xiàng)檢測不依賴于現(xiàn)有的檢測硬件和試劑。眾所周知,目前全球都面臨RT-qPCR設(shè)備和試劑的短缺。
LamPORE檢測不僅快速,還具有可擴(kuò)展性,可同時(shí)運(yùn)行多個(gè)樣本。利用便攜式的MinION測序設(shè)備,大約1小時(shí)可分析96個(gè)樣本,在4.5小時(shí)內(nèi)可分析1,152個(gè)樣本。若利用臺(tái)式的GridION測序設(shè)備,在同樣的時(shí)間內(nèi)能夠處理五倍數(shù)量的樣本。該檢測適用于鼻咽拭子或唾液樣本。
據(jù)介紹,LamPORE方法還有進(jìn)一步開發(fā)的潛力,有望同時(shí)檢測包括SARS-CoV-2病毒在內(nèi)的多種病原體。隨著時(shí)間的推移,當(dāng)COVID-19的患病率下降,而其他呼吸道病原體的患病率上升時(shí),這有望發(fā)揮作用。
LamPORE檢測可以在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)集中開展,應(yīng)用于一線員工的例行檢查或復(fù)工后的大規(guī)模檢查。同時(shí),它也可以部署在本地化環(huán)境中,比如養(yǎng)老院、交通樞紐、企業(yè)或其他社區(qū)環(huán)境??焖俚闹苻D(zhuǎn)流程對(duì)于迅速隔離疑似患者和防止病毒繼續(xù)傳播特別重要。
Oxford Nanopore首席執(zhí)行官Gordon Sanghera博士表示:“我們設(shè)計(jì)的首款納米孔測序儀可被任何科學(xué)家在任何地方使用。現(xiàn)在,借助LamPORE,我們希望將納米孔測序的普適性和可擴(kuò)展性引入快速分析領(lǐng)域?!?/p>
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原文標(biāo)題:Oxford Nanopore開發(fā)出快速且低成本的新冠檢測產(chǎn)品
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