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如何高效的使用Python和pandas清理非結(jié)構(gòu)化文本字段技巧

數(shù)據(jù)分析與開發(fā) ? 來源:數(shù)據(jù)分析與開發(fā) ? 作者:數(shù)據(jù)分析與開發(fā) ? 2021-04-06 13:43 ? 次閱讀
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介紹

大家都知道數(shù)據(jù)清洗是數(shù)據(jù)分析過程中的一個重要部分。pandas有多種清洗文本字段的方法,可以用來為進一步分析做準備。隨著數(shù)據(jù)集越來越大,文本清洗的過程會逐漸變長,尋找一個能在合理時間內(nèi)有效運行并可維護的方法變得非常重要。

本文將展示清洗大數(shù)據(jù)文件中文本字段的示例,幫助大家學習使用 Python 和 pandas 高效清理非結(jié)構(gòu)化文本字段的技巧。

問題

假設(shè)你有一批全新工藝的威士忌想出售。你所在的愛荷華州,剛好有一個公開的數(shù)據(jù)集顯示了該州所有的酒類銷售情況。這似乎是一個很好的機會,你可以利用你的分析技能,看看誰是這個州最大的客戶。有了這些數(shù)據(jù),你甚至可以為每個客戶規(guī)劃銷售流程。

你對這個機會感到興奮,但下載了數(shù)據(jù)后發(fā)現(xiàn)它相當大。這個數(shù)據(jù)集是一個565MB的CSV文件,包含24列和2.3百萬行。它雖然不是我們平時說的“大數(shù)據(jù)”,但它依然足夠大到可以讓Excel卡死。同時它也大到讓一些pandas方法在比較慢的筆記本電腦上運行地非常吃力。

本文中,我們將使用包括2019年所有銷售額的數(shù)據(jù)。當然你也可以從網(wǎng)站上下載其他不同時間段的數(shù)據(jù)。

我們從導入模塊和讀取數(shù)據(jù)開始,我會使用sidetable包來查看數(shù)據(jù)的概覽。這個包雖然不能用來做清洗,但我想強調(diào)一下它對于這些數(shù)據(jù)探索場景其實很有用。

數(shù)據(jù)

讀取數(shù)據(jù):

import pandas as pd

import numpy as np

import sidetable

df = pd.read_csv(‘2019_Iowa_Liquor_Sales.csv’)

數(shù)據(jù)長這樣:

7240cd9e-9531-11eb-8b86-12bb97331649.png

我們大概率要做的第一件事是看每一家商店的購買量,并將它們從大到小排序。資源有限所以我們應(yīng)該集中精力在那些我們能從中獲得最好回報的地方。我們更應(yīng)該打電話給幾個大公司的賬戶,而不是那些夫妻小店。

sidetable是以可讀格式匯總數(shù)據(jù)的快捷方式。另一種方法是groupby加上其他操作。

df.stb.freq([‘Store Name’], value=‘Sale (Dollars)’, style=True, cum_cols=False)

724cd544-9531-11eb-8b86-12bb97331649.png

很明顯在大多數(shù)情況下,每個位置的商店名稱都是唯一的。理想情況下我們希望看到的是Hy-Vee, Costco, Sam’s 等聚合在一起的內(nèi)容。

看來我們需要清洗數(shù)據(jù)了。

清洗嘗試·1

我們可以研究的第一種方法是使用.loc以及str的布爾過濾器來搜索Store Name列中的相關(guān)字符串。

df.loc[df[‘Store Name’].str.contains(‘Hy-Vee’, case=False), ‘Store_Group_1’] = ‘Hy-Vee’

上述代碼使用不區(qū)分大小寫的方式來搜索字符串“Hy Vee”,并將值“Hy Vee”存儲在名為Store_Group_1的新列中。這個代碼可以有效地將“Hy Vee#3/BDI/Des Moines”或“Hy Vee Food Store/Urbandale”等名稱轉(zhuǎn)換為正常的“Hy Vee”。

用%%timeit來計算此操作的時間:

1.43 s ± 31.8 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1 loop each)

我們不想過早地進行優(yōu)化,但我們可以使用regex=False參數(shù)來稍微加速一下:

df.loc[df[‘Store Name’].str.contains(‘Hy-Vee’, case=False, regex=False), ‘Store_Group_1’] = ‘Hy-Vee’

804 ms ± 27.9 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1 loop each)

來看下新列的情況:

df[‘Store_Group_1’].value_counts(dropna=False)

NaN 1617777

Hy-Vee 762568

Name: Store_Group_1, dtype: int64

可以看到我們已經(jīng)清理了Hy-Vee,但還有很多其他值需要我們處理。

.loc方法內(nèi)部包含大量代碼,速度其實可能很慢。我們可以利用這個思想,來尋找一些更易于執(zhí)行和維護的替代方案。

清洗嘗試·2

另一種非常有效和靈活的方法是使用np.select來進行多匹配并在匹配時指定值。

有幾個很好的資源可以幫你學習如何使用np.select。這篇來自Dataquest的文章就是一個很好的概述。Nathan Cheever的這篇演講也十分有趣,內(nèi)容豐富。我建議你們可以看下這兩篇文章。

關(guān)于np.select的作用最簡單的解釋是,它計算一個條件列表,如果有條件為真,就應(yīng)用相應(yīng)值的列表。

在我們的例子中,我們想查找不同的字符串,來替換為我們想要的規(guī)范值。

瀏覽完我們的數(shù)據(jù)后,我們把條件和值列表總結(jié)在store_patterns列表中。列表中的每個元組都是一個str.contains()方法,來查找和替換對應(yīng)的我們想要做聚合的規(guī)范值。

store_patterns = [

(df[‘Store Name’].str.contains(‘Hy-Vee’, case=False, regex=False), ‘Hy-Vee’),

(df[‘Store Name’].str.contains(‘Central City’,

case=False, regex=False), ‘Central City’),

(df[‘Store Name’].str.contains(“Smokin‘ Joe’s”,

case=False, regex=False), “Smokin‘ Joe’s”),

(df[‘Store Name’].str.contains(‘Walmart|Wal-Mart’,

case=False), ‘Wal-Mart’),

(df[‘Store Name’].str.contains(‘Fareway Stores’,

case=False, regex=False), ‘Fareway Stores’),

(df[‘Store Name’].str.contains(“Casey‘s”,

case=False, regex=False), “Casey’s General Store”),

(df[‘Store Name’].str.contains(“Sam‘s Club”, case=False, regex=False), “Sam’s Club”),

(df[‘Store Name’].str.contains(‘Kum & Go’, regex=False, case=False), ‘Kum & Go’),

(df[‘Store Name’].str.contains(‘CVS’, regex=False, case=False), ‘CVS Pharmacy’),

(df[‘Store Name’].str.contains(‘Walgreens’, regex=False, case=False), ‘Walgreens’),

(df[‘Store Name’].str.contains(‘Yesway’, regex=False, case=False), ‘Yesway Store’),

(df[‘Store Name’].str.contains(‘Target Store’, regex=False, case=False), ‘Target’),

(df[‘Store Name’].str.contains(‘Quik Trip’, regex=False, case=False), ‘Quik Trip’),

(df[‘Store Name’].str.contains(‘Circle K’, regex=False, case=False), ‘Circle K’),

(df[‘Store Name’].str.contains(‘Hometown Foods’, regex=False,

case=False), ‘Hometown Foods’),

(df[‘Store Name’].str.contains(“Bucky‘s”, case=False, regex=False), “Bucky’s Express”),

(df[‘Store Name’].str.contains(‘Kwik’, case=False, regex=False), ‘Kwik Shop’)

使用np.select很容易遇到條件和值不匹配的情況。所以我們將其合并為元組,以便更容易地跟蹤數(shù)據(jù)匹配。

想使用這種數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu),我們需要將元組分成兩個單獨的列表。使用zip來把store_patterns分為store_criteria和store_values:

store_criteria, store_values = zip(*store_patterns)

df[‘Store_Group_1’] = np.select(store_criteria, store_values, ‘other’)

上述代碼將用文本值填充每個匹配項。如果沒有匹配項,我們給它賦值‘other’。

數(shù)據(jù)現(xiàn)在長這樣:

df.stb.freq([‘Store_Group_1’], value=‘Sale (Dollars)’, style=True, cum_cols=False)

72fa307c-9531-11eb-8b86-12bb97331649.png

看起來比之前好,但仍然有32.28%的‘other’。

思考下這樣做是不是更好:如果帳戶不匹配,我們使用Store Name字段,而不是‘other’。這樣來實現(xiàn):

df[‘Store_Group_1’] = np.select(store_criteria, store_values, None)

df[‘Store_Group_1’] = df[‘Store_Group_1’].combine_first(df[‘Store Name’])

這里使用了combine_first方法來將Store Name填充None值,這是清理數(shù)據(jù)時要記住的一個簡便技巧。

再來看下數(shù)據(jù):

df.stb.freq([‘Store_Group_1’], value=‘Sale (Dollars)’, style=True, cum_cols=False)

73267eb6-9531-11eb-8b86-12bb97331649.png

這樣看起來更好了,我們可以根據(jù)需要繼續(xù)細化分組。例如我們可能需要為Costco構(gòu)建一個字符串查找。

對于這個大型數(shù)據(jù)集來說,性能也還不錯:

13.2 s ± 328 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1 loop each)

這個方法的好處是你可以使用np.select來做數(shù)值分析或者上面展示的文本示例,非常靈活。這個方法也有一個弊端,那就是代碼量很大。如果你要清理的數(shù)據(jù)集非常大,那么用這個方法可能導致很多數(shù)據(jù)和代碼混合在一起。那么有沒有其他方法可以有差不多的性能,代碼更整潔一些?

清洗嘗試·3

這里要介紹的解決方案基于Matt Harrison的優(yōu)秀代碼示例,他開發(fā)了一個可以做匹配和清洗的generalize函數(shù)。我做了一些修改,讓這個方法可以在這個示例中使用,我想給Matt一個大大的贊。如果沒有他前期99%的工作,我永遠不會想到這個解決方案!

def generalize(ser, match_name, default=None, regex=False, case=False):

“”“ Search a series for text matches.

Based on code from https://www.metasnake.com/blog/pydata-assign.html

ser: pandas series to search

match_name: tuple containing text to search for and text to use for normalization

default: If no match, use this to provide a default value, otherwise use the original text

regex: Boolean to indicate if match_name contains a regular expression

case: Case sensitive search

Returns a pandas series with the matched value

”“”

seen = None

for match, name in match_name:

mask = ser.str.contains(match, case=case, regex=regex)

if seen is None:

seen = mask

else:

seen |= mask

ser = ser.where(~mask, name)

if default:

ser = ser.where(seen, default)

else:

ser = ser.where(seen, ser.values)

return ser

這個函數(shù)可以在pandas上調(diào)用,傳參是一個元組列表。第一個元組項是要搜索的值,第二個是要為匹配值填充的值。

以下是等效的模式列表:

store_patterns_2 = [(‘Hy-Vee’, ‘Hy-Vee’), (“Smokin‘ Joe’s”, “Smokin‘ Joe’s”),

(‘Central City’, ‘Central City’),

(‘Costco Wholesale’, ‘Costco Wholesale’),

(‘Walmart’, ‘Walmart’), (‘Wal-Mart’, ‘Walmart’),

(‘Fareway Stores’, ‘Fareway Stores’),

(“Casey‘s”, “Casey’s General Store”),

(“Sam‘s Club”, “Sam’s Club”), (‘Kum & Go’, ‘Kum & Go’),

(‘CVS’, ‘CVS Pharmacy’), (‘Walgreens’, ‘Walgreens’),

(‘Yesway’, ‘Yesway Store’), (‘Target Store’, ‘Target’),

(‘Quik Trip’, ‘Quik Trip’), (‘Circle K’, ‘Circle K’),

(‘Hometown Foods’, ‘Hometown Foods’),

(“Bucky‘s”, “Bucky’s Express”), (‘Kwik’, ‘Kwik Shop’)]

這個方案的一個好處是,與前面的store_patterns示例相比,維護這個列表要容易得多。

我對generalize函數(shù)做的另一個更改是,如果沒有提供默認值,那么將保留原始值,而不是像上面那樣使用combine_first函數(shù)。最后,為了提高性能,我默認關(guān)閉了正則匹配。

現(xiàn)在數(shù)據(jù)都設(shè)置好了,調(diào)用它很簡單:

df[‘Store_Group_2’] = generalize(df[‘Store Name’], store_patterns_2)

性能如何?

15.5 s ± 409 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1 loop each)

比起上面它稍微有一點慢,但我認為它是一個更優(yōu)雅的解決方案,如果我要做一個類似的文本清理工作,我會用這個方法。

這種方法的缺點是,它只能做字符串清洗。而np.select也可以應(yīng)用于數(shù)值,所以應(yīng)用范圍更廣。

關(guān)于數(shù)據(jù)類型

在pandas的最新版本中,有一個專用的字符串類型。我嘗試將Store Name轉(zhuǎn)換為該字符串類型,想看是否有性能優(yōu)化。結(jié)果沒有看到任何變化。不過,未來有可能會有速度的提升,這點大家可以關(guān)注一下。

雖然string類型沒有什么區(qū)別,但是category類型在這個數(shù)據(jù)集上顯示了很大的潛力。有關(guān)category數(shù)據(jù)類型的詳細信息,可以參閱我的上一篇文章:https://pbpython.com/pandas_dtypes_cat.html。

我們可以使用astype將數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為category類型:

df[‘Store Name’] = df[‘Store Name’].astype(‘category’)

然后我們跟之前那樣在運行np.select的方法

df[‘Store_Group_3’] = np.select(store_criteria, store_values, None)

df[‘Store_Group_3’] = df[‘Store_Group_1’].combine_first(df[‘Store Name’])

786 ms ± 108 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1 loop each)

我們只做了一個簡單的改動,運行時間從13秒到不到1秒。太神了!效果這么明顯的原因其實很簡單。當pandas將列轉(zhuǎn)換為分組類型時,它只會對每個唯一的文本值調(diào)用珍貴的str.contains()函數(shù)。因為這個數(shù)據(jù)集有很多重復(fù)的數(shù)據(jù),所以我們得到了巨大的性能提升。

讓我們看看這是否適用于我們的generalize函數(shù):

df[‘Store_Group_4’] = generalize(df[‘Store Name’], store_patterns_2)

不幸的是報錯了:

ValueError: Cannot setitem on a Categorical with a new category, set the categories first

這個錯誤讓我回憶起我過去處理分組數(shù)據(jù)時遇到的一些挑戰(zhàn)。當你合并和關(guān)聯(lián)分組數(shù)據(jù)時,你很容易遇到這些錯誤。

我試圖找到一個比較好的方法來修改generage(),想讓它起作用,但目前還沒找到。如果有任何讀者能找到方法,可以聯(lián)系我獲得獎金。這里,我們通過構(gòu)建一個查找表來復(fù)制Category方法。

查找表

正如我們通過分類方法了解到的,這個數(shù)據(jù)集有很多重復(fù)的數(shù)據(jù)。我們可以構(gòu)建一個查找表,每個字符串處理一次資源密集型函數(shù)。

為了說明它是如何在字符串上工作的,我們將值從category轉(zhuǎn)換回字符串類型:

df[‘Store Name’] = df[‘Store Name’].astype(‘string’)

首先,我們構(gòu)建一個包含所有唯一值的lookup DataFrame并運行g(shù)eneralize函數(shù):

lookup_df = pd.DataFrame()

lookup_df[‘Store Name’] = df[‘Store Name’].unique()

lookup_df[‘Store_Group_5’] = generalize(lookup_df[‘Store Name’], store_patterns_2)

7338d782-9531-11eb-8b86-12bb97331649.png

我們可以把它合并到最終的DataFrame:

df = pd.merge(df, lookup_df, how=‘left’)

1.38 s ± 15.1 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1 loop each)

比起np.select使用分組數(shù)據(jù)的方法稍慢一些,但是代碼可讀性和易維護程度更高,性能和這兩者之間其實需要掌握一個平衡。

此外,中間的lookup_df可以很好的輸出給分析師共享,從而讓分析師幫助你清洗更多數(shù)據(jù)。這可能節(jié)省你幾小時的時間!

總結(jié)

根據(jù)我的經(jīng)驗,通過本文中概述的清洗示例,你可以了解很多關(guān)于底層數(shù)據(jù)的信息。

我推測你會在你的日常分析中發(fā)現(xiàn)很多需要進行文本清理的案例,就像我在本文中展示的那樣。

下面是本文解決方案的簡要總結(jié):

解決方案執(zhí)行時間注釋

np.select13s可用于非文本分析

generalize15s只支持文本

分組數(shù)據(jù)和np.select786ms在合并和關(guān)聯(lián)時,分組數(shù)據(jù)可能會變得棘手

查找表和generalize1.3s查找表可以由其他人維護

對于一些數(shù)據(jù)集來說,性能不是問題,所以你可以隨意選擇。

然而,隨著數(shù)據(jù)規(guī)模的增長(想象一下對50個州的數(shù)據(jù)進行分析),你需要了解如何高效地使用pandas進行文本清洗。我建議你可以收藏這篇文章,當你面對類似的問題時可以再回來看看。

當然,如果你有一些其他的建議,可能會對別人有用,可以寫在評論里。如果你知道如何使我的generalize函數(shù)與分組數(shù)據(jù)一起工作,也記得告訴我。
編輯:lyn

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原文標題:用 pandas 高效清洗文本數(shù)據(jù)

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    Python 給 Amazon 做“全身 CT”——可量產(chǎn)、可擴展的商品詳情爬蟲實戰(zhàn)

    一、技術(shù)選型:為什么選 Python 而不是 Java? 結(jié)論: “調(diào)研階段用 Python,上線后如果 QPS 爆表再考慮 Java 重構(gòu)。” 二、整體架構(gòu)速覽(3 分鐘看懂) 三、開發(fā)前準備(5
    的頭像 發(fā)表于 10-21 16:59 ?631次閱讀
    用 <b class='flag-5'>Python</b> 給 Amazon 做“全身 CT”——可量產(chǎn)、可擴展的商品詳情爬蟲實戰(zhàn)

    NetApp助力對象存儲現(xiàn)代,提升速度、可擴展性和安全性

    計。最新版本的StorageGRID將引入新功能,旨在推進人工智能計劃、提高數(shù)據(jù)安全性并實現(xiàn)企業(yè)數(shù)據(jù)基礎(chǔ)設(shè)施的現(xiàn)代。 無論企業(yè)是處于數(shù)據(jù)湖現(xiàn)代的早期階段,還是正在試驗高級人工智能應(yīng)用程序,他們都需要管理并存儲激增的
    的頭像 發(fā)表于 09-11 10:41 ?680次閱讀

    深度學習對工業(yè)物聯(lián)網(wǎng)有哪些幫助

    、實施路徑三個維度展開分析: 一、深度學習如何突破工業(yè)物聯(lián)網(wǎng)的技術(shù)瓶頸? 1. 結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)處理:解鎖“沉睡數(shù)據(jù)”價值 傳統(tǒng)困境 :工業(yè)物聯(lián)網(wǎng)中70%以上的數(shù)據(jù)為結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)(如設(shè)備振
    的頭像 發(fā)表于 08-20 14:56 ?1235次閱讀

    智能體AI面臨結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)難題:IBM推出解決方案

    ,同時提供一個開放的混合數(shù)據(jù)基礎(chǔ)架構(gòu)和企業(yè)級的結(jié)構(gòu)化結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)管理。 智能體AI面臨結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)難題:IBM推出解決方案 測試結(jié)果顯示,
    的頭像 發(fā)表于 07-02 09:40 ?681次閱讀

    DDN攜手NVIDIA釋放結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)的AI價值

    DDN 通過與 NVIDIA AI 數(shù)據(jù)平臺的合作,推出聯(lián)合解決方案,簡化了企業(yè)對結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)的存儲、訪問和激活方式,助力客戶釋放生成式 AI 的巨大商業(yè)潛能。DDN 全球合作伙伴負責人
    的頭像 發(fā)表于 06-10 10:31 ?1077次閱讀