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DPU為高性能計算系統(tǒng)提供空前的創(chuàng)新空間

NVIDIA英偉達企業(yè)解決方案 ? 來源:NVIDIA英偉達企業(yè)解決方案 ? 作者:NVIDIA英偉達企業(yè)解 ? 2021-09-12 10:17 ? 次閱讀
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為了滿足更先進的科研需求,全球各地的學(xué)術(shù)機構(gòu)都在致力于重新設(shè)計代碼和算法。英國的面向 E 級計算算法和基礎(chǔ)設(shè)施優(yōu)化的 ExCALIBUR (the Exascale Computing ALgorithms and Infrastructures Benefiting UK Research) 項目就是這樣一個致力于為英國最重要的研究領(lǐng)域提供新一代高性能模擬軟件的科研項目。這些領(lǐng)域涉及到計算高度密集型的應(yīng)用,例如模擬整個宇宙的演變、了解地震波和引力波、評估海嘯以及對物質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)進行建模等。

新型計算方案的出現(xiàn),包括智能且可編程的互連解決方案如 DPU(數(shù)據(jù)處理器)等,為研究人員在新的高性能計算系統(tǒng)上提供了空前的創(chuàng)新空間。NVIDIA BlueField DPU 集強大的網(wǎng)絡(luò)計算引擎、高速網(wǎng)絡(luò)和豐富的可編程性于一體,為最苛刻的應(yīng)用提供了軟件定義、硬件加速的解決方案。

擁有分布在劍橋大學(xué)、萊斯特大學(xué)、杜倫大學(xué)和愛丁堡大學(xué)這四所大學(xué)的計算資源的 DiRAC(Distributed Research utilising Advanced Computing)正在參與ExCALIBUR 項目,正在以全新的方式利用 BlueField DPU 豐富的可編程能力助力科學(xué)突破。

例如杜倫大學(xué)的計算宇宙學(xué)院和計算機科學(xué)系,他們正在對地震波和引力波的傳播進行大規(guī)模模擬,該模擬使用動態(tài)笛卡爾網(wǎng)格和 ExaHyPE 代碼將大部分的計算轉(zhuǎn)化為多任務(wù)操作。

在過去幾年中,他們付出了大量的精力來標(biāo)記和識別那些需要與其它網(wǎng)格發(fā)生變化的節(jié)點或任務(wù)同步的關(guān)鍵任務(wù)。由于存在大量的低優(yōu)先級任務(wù),保證整個系統(tǒng)的負(fù)載平衡的工作量將會很大。即使達到最佳負(fù)載平衡后,一旦域內(nèi)任何參數(shù)發(fā)生變化,系統(tǒng)立刻就會隨之變得不平衡,要想再次達到最佳負(fù)載平衡會非常困難并且會耗費大量的時間或成本。

為了提升系統(tǒng)的應(yīng)變能力,研究人員必須將輕量任務(wù)和閑置任務(wù)轉(zhuǎn)移到其它資源上,但是,編排就會變得十分困難,同時通過調(diào)節(jié) MPI 運行時來確保在正確的時間用正確的步長來進行計算,也會搶占計算資源。

憑借 BlueField DPU 計算核,杜倫大學(xué)可以使用 DPU 作為 MPI 處理引擎來節(jié)省計算資源,例如觀察和引導(dǎo)任務(wù),以及及時緩存/接受任務(wù)等。這項工作延伸了 ExaHyPE 組織內(nèi)部的研究合作,尤其是 TUM 的 Michael Bader 小組,對于以 CPU 核心的計算任務(wù)提出來一個全新的觀點,即開始由智能網(wǎng)絡(luò)承擔(dān)起數(shù)據(jù)處理工作。

倫敦大學(xué)學(xué)院的研究生 James Legg 正在使用 BlueField DPU 通過使用基于任務(wù)的調(diào)度機制來加速計算代碼。James 的研究方向就是使用 BlueField DPU,尤其是其 Arm 處理器子系統(tǒng)來作為任務(wù)調(diào)度器,由主機處理器來運行計算任務(wù)或內(nèi)核。這顛覆了傳統(tǒng)的加速卡運行在內(nèi)核,由主機來管理所有任務(wù)的認(rèn)知。以前,當(dāng)調(diào)度器和內(nèi)核都在主機上運行時,它們會強奪處理器資源,使得調(diào)度器的設(shè)計必須簡單。在 BlueField DPU 上,調(diào)度器可以輕松擁有幾個專用線程,實現(xiàn)了調(diào)度處理和與主機運行內(nèi)核的并行化,并可以執(zhí)行更復(fù)雜的調(diào)度操作。另外一項研究是如何在主機處理器完全不參與的情況下,利用 BlueField DPU 上的調(diào)度器在任意主機 RAM 之間移動計算數(shù)據(jù)。

CSD3 (Cambridge Service for Data Driven Discovery)是英國國家研究云,同時也是世界上性能最強大的科研云原生超級計算機之一。CSD3 通過 BlueField DPU 來卸載主機上的安全策略和存儲框架等基礎(chǔ)設(shè)施管理操作,同時提供了應(yīng)用的加速與隔離,以此實現(xiàn)了 I/O 性能的最大化。這既實現(xiàn)了安全性又得到了裸金屬性能,使研究人員能夠以全新的方式進行研究。

以上只是研究人員如何利用 DPU 性能和可編程性來探索創(chuàng)新的一部分。為了進一步簡化編程,加速創(chuàng)新,NVIDIA 推出了 DOCA SDK,使基礎(chǔ)設(shè)施開發(fā)人員能夠使用行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)的 API,在 BlueField DPU 上快速創(chuàng)建網(wǎng)絡(luò)、存儲、安全、管理以及 AI 和高性能計算(HPC)應(yīng)用和服務(wù)。憑借 DOCA,開發(fā)人員可以通過創(chuàng)建高性能、軟件定義和云原生的 DPU 加速服務(wù),對未來的超級計算基礎(chǔ)設(shè)施進行編程。現(xiàn)在,開發(fā)人員即可通過注冊提前體驗。

責(zé)任編輯:haq

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原文標(biāo)題:DPU 助力英國高性能計算研究人員創(chuàng)新和改進超算基礎(chǔ)設(shè)施

文章出處:【微信號:NVIDIA-Enterprise,微信公眾號:NVIDIA英偉達企業(yè)解決方案】歡迎添加關(guān)注!文章轉(zhuǎn)載請注明出處。

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