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如何使用python減少數(shù)據(jù)集中的特性數(shù)量

QQ475400555 ? 來源:機(jī)器視覺沙龍 ? 作者:機(jī)器視覺沙龍 ? 2022-11-15 09:40 ? 次閱讀
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簡 介:據(jù)《福布斯》報(bào)道,每天大約會有 250 萬字節(jié)的數(shù)據(jù)被產(chǎn)生。然后,可以使用數(shù)據(jù)科學(xué)和機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù)對這些數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,以便提供分析和作出預(yù)測。盡管在大多數(shù)情況下,在開始任何統(tǒng)計(jì)分析之前,需要先對最初收集的數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理。有許多不同的原因?qū)е滦枰M(jìn)行預(yù)處理分析,例如:

收集的數(shù)據(jù)格式不對(如 SQL 數(shù)據(jù)庫、JSON、CSV 等)

缺失值和異常值

標(biāo)準(zhǔn)化

減少數(shù)據(jù)集中存在的固有噪聲(部分存儲數(shù)據(jù)可能已損壞)

數(shù)據(jù)集中的某些功能可能無法收集任何信息以供分析

在本文中,我將介紹如何使用 python 減少 kaggle Mushroom Classification 數(shù)據(jù)集中的特性數(shù)量。本文中使用的所有代碼在?kaggle 和我的?github 帳號上都有。減少統(tǒng)計(jì)分析期間要使用的特征的數(shù)量可能會帶來一些好處,例如:

高精度

降低過擬合風(fēng)險(xiǎn)

加快訓(xùn)練速度

改進(jìn)數(shù)據(jù)可視化

增加我們模型的可解釋性

事實(shí)上,統(tǒng)計(jì)上證明,當(dāng)執(zhí)行機(jī)器學(xué)習(xí)任務(wù)時(shí),存在針對每個(gè)特定任務(wù)應(yīng)該使用的最佳數(shù)量的特征(圖 1)。如果添加的特征比必要的特征多,那么我們的模型性能將下降(因?yàn)樘砑恿嗽肼暎U嬲奶魬?zhàn)是找出哪些特征是最佳的使用特征(這實(shí)際上取決于我們提供的數(shù)據(jù)量和我們正在努力實(shí)現(xiàn)的任務(wù)的復(fù)雜性)。這就是特征選擇技術(shù)能夠幫到我們的地方!

圖 1:分類器性能和維度之間的關(guān)系特征選擇 有許多不同的方法可用于特征選擇。其中最重要的是:1.過濾方法=過濾我們的數(shù)據(jù)集,只取包含所有相關(guān)特征的子集(例如,使用 Pearson 相關(guān)的相關(guān)矩陣)。2.遵循過濾方法的相同目標(biāo),但使用機(jī)器學(xué)習(xí)模型作為其評估標(biāo)準(zhǔn)(例如,向前/向后/雙向/遞歸特征消除)。我們將一些特征輸入機(jī)器學(xué)習(xí)模型,評估它們的性能,然后決定是否添加或刪除特征以提高精度。因此,這種方法可以比濾波更精確,但計(jì)算成本更高。3.嵌入方法。與過濾方法一樣,嵌入方法也使用機(jī)器學(xué)習(xí)模型。這兩種方法的區(qū)別在于,嵌入的方法檢查 ML 模型的不同訓(xùn)練迭代,然后根據(jù)每個(gè)特征對 ML 模型訓(xùn)練的貢獻(xiàn)程度對每個(gè)特征的重要性進(jìn)行排序。

圖 2:過濾器、包裝器和嵌入式方法表示 [3]實(shí)踐 在本文中,我將使用 Mushroom Classification 數(shù)據(jù)集,通過查看給定的特征來嘗試預(yù)測蘑菇是否有毒。在這樣做的同時(shí),我們將嘗試不同的特征消除技術(shù),看看它們會如何影響訓(xùn)練時(shí)間和模型整體的精度。首先,我們需要導(dǎo)入所有必需的庫。

152b247e-6479-11ed-8abf-dac502259ad0.png

我們將在本例中使用的數(shù)據(jù)集如下圖所示。

153410b6-6479-11ed-8abf-dac502259ad0.png

圖 3:Mushroom Classification 數(shù)據(jù)集在將這些數(shù)據(jù)輸入機(jī)器學(xué)習(xí)模型之前,我決定對所有分類變量進(jìn)行 one hot 編碼,將數(shù)據(jù)分為特征(x)和標(biāo)簽(y),最后在訓(xùn)練集和測試集中進(jìn)行。
X = df.drop(['class'], axis = 1)
Y = df['class']
X = pd.get_dummies(X, prefix_sep='_')
Y = LabelEncoder().fit_transform(Y)


X2 = StandardScaler().fit_transform(X)


X_Train, X_Test, Y_Train, Y_Test = train_test_split(X2, Y, test_size = 0.30, 

特征重要性

基于集合的決策樹模型(如隨機(jī)森林)可以用來對不同特征的重要性進(jìn)行排序。了解我們的模型最重要的特征對于理解我們的模型如何做出預(yù)測(使其更易于解釋)是至關(guān)重要的。同時(shí),我們可以去掉那些對我們的模型沒有任何好處的特征。

start = time.process_time()
trainedforest = RandomForestClassifier(n_estimators=700).fit(X_Train,Y_Train)
print(time.process_time() - start)
predictionforest = trainedforest.predict(X_Test)
print(confusion_matrix(Y_Test,predictionforest))
print(classification_report(Y_Test,predictionforest))
如下圖所示,使用所有特征訓(xùn)練一個(gè)隨機(jī)森林分類器,在大約 2.2 秒的訓(xùn)練時(shí)間內(nèi)獲得 100% 的準(zhǔn)確率。在下面的每個(gè)示例中,每個(gè)模型的訓(xùn)練時(shí)間都將打印在每個(gè)片段的第一行,供你參考。

15411374-6479-11ed-8abf-dac502259ad0.png

一旦我們的隨機(jī)森林分類器得到訓(xùn)練,我們就可以創(chuàng)建一個(gè)特征重要性圖,看看哪些特征對我們的模型預(yù)測來說是最重要的(圖 4)。在本例中,下面只顯示了前 7 個(gè)特性。
figure(num=None, figsize=(20, 22), dpi=80, facecolor='w', edgecolor='k')


feat_importances = pd.Series(trainedforest.feature_importances_, index= X.columns)
feat_importances.nlargest(7).plot(kind='barh')

154acd6a-6479-11ed-8abf-dac502259ad0.png

圖 4:特征重要性圖現(xiàn)在我們知道了哪些特征被我們的隨機(jī)森林認(rèn)為是最重要的,我們可以嘗試使用前 3 個(gè)來訓(xùn)練我們的模型。
X_Reduced = X[['odor_n','odor_f', 'gill-size_n','gill-size_b']]
X_Reduced = StandardScaler().fit_transform(X_Reduced)
X_Train2, X_Test2, Y_Train2, Y_Test2 = train_test_split(X_Reduced, Y, test_size = 0.30,  random_state = 101)


start = time.process_time()
trainedforest = RandomForestClassifier(n_estimators=700).fit(X_Train2,Y_Train2)
print(time.process_time() - start)
predictionforest = trainedforest.predict(X_Test2)
print(confusion_matrix(Y_Test2,predictionforest))
print(classification_report(Y_Test2,predictionforest))
正如我們在下面看到的,僅僅使用 3 個(gè)特征,只會導(dǎo)致準(zhǔn)確率下降 0.03%,訓(xùn)練時(shí)間減少一半。

1554232e-6479-11ed-8abf-dac502259ad0.png

我們還可以通過可視化一個(gè)訓(xùn)練過的決策樹來理解如何進(jìn)行特征選擇。
start = time.process_time()
trainedtree = tree.DecisionTreeClassifier().fit(X_Train, Y_Train)
print(time.process_time() - start)
predictionstree = trainedtree.predict(X_Test)
print(confusion_matrix(Y_Test,predictionstree))
print(classification_report(Y_Test,predictionstree))

15616138-6479-11ed-8abf-dac502259ad0.png

樹結(jié)構(gòu)頂部的特征是我們的模型為了執(zhí)行分類而保留的最重要的特征。因此,只選擇頂部的前幾個(gè)特征,而放棄其他特征,可能創(chuàng)建一個(gè)準(zhǔn)確度非??捎^的模型。
import graphviz
from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier, export_graphviz




data = export_graphviz(trainedtree,out_file=None,feature_names= X.columns,
        class_names=['edible', 'poisonous'], 
        filled=True, rounded=True, 
        max_depth=2,
        special_characters=True)
graph = graphviz.Source(data)
graph

156cb6d2-6479-11ed-8abf-dac502259ad0.png

圖 5:決策樹可視化

遞歸特征消除(RFE)

遞歸特征消除(RFE)將機(jī)器學(xué)習(xí)模型的實(shí)例和要使用的最終期望特征數(shù)作為輸入。然后,它遞歸地減少要使用的特征的數(shù)量,采用的方法是使用機(jī)器學(xué)習(xí)模型精度作為度量對它們進(jìn)行排序。創(chuàng)建一個(gè) for 循環(huán),其中輸入特征的數(shù)量是我們的變量,這樣就可以通過跟蹤在每個(gè)循環(huán)迭代中注冊的精度,找出我們的模型所需的最佳特征數(shù)量。使用 RFE 支持方法,我們可以找出被評估為最重要的特征的名稱(rfe.support 返回一個(gè)布爾列表,其中 true 表示一個(gè)特征被視為重要,false 表示一個(gè)特征不重要)。

from sklearn.feature_selection import RFE


model = RandomForestClassifier(n_estimators=700)
rfe = RFE(model, 4)
start = time.process_time()
RFE_X_Train = rfe.fit_transform(X_Train,Y_Train)
RFE_X_Test = rfe.transform(X_Test)
rfe = rfe.fit(RFE_X_Train,Y_Train)
print(time.process_time() - start)
print("Overall Accuracy using RFE: ", rfe.score(RFE_X_Test,Y_Test))

1576e5c6-6479-11ed-8abf-dac502259ad0.png

SelecFromModel

selectfrommodel 是另一種 scikit 學(xué)習(xí)方法,可用于特征選擇。此方法可用于具有 coef 或 feature 重要性屬性的所有不同類型的 scikit 學(xué)習(xí)模型(擬合后)。與 rfe 相比,selectfrommodel 是一個(gè)不太可靠的解決方案。實(shí)際上,selectfrommodel 只是根據(jù)計(jì)算出的閾值(不涉及優(yōu)化迭代過程)刪除不太重要的特性。為了測試 selectfrommodel 的有效性,我決定在這個(gè)例子中使用一個(gè) ExtraTreesClassifier。ExtratreesClassifier(極端隨機(jī)樹)是基于樹的集成分類器,與隨機(jī)森林方法相比,它可以產(chǎn)生更少的方差(因此減少了過擬合的風(fēng)險(xiǎn))。隨機(jī)森林和極隨機(jī)樹的主要區(qū)別在于極隨機(jī)樹中節(jié)點(diǎn)的采樣不需要替換。

from sklearn.ensemble import ExtraTreesClassifier
from sklearn.feature_selection import SelectFromModel


model = ExtraTreesClassifier()
start = time.process_time()
model = model.fit(X_Train,Y_Train)
model = SelectFromModel(model, prefit=True)
print(time.process_time() - start)
Selected_X = model.transform(X_Train)


start = time.process_time()
trainedforest = RandomForestClassifier(n_estimators=700).fit(Selected_X, Y_Train)
print(time.process_time() - start)
Selected_X_Test = model.transform(X_Test)
predictionforest = trainedforest.predict(Selected_X_Test)
print(confusion_matrix(Y_Test,predictionforest))
print(classification_report(Y_Test,predictionforest))

15840c6a-6479-11ed-8abf-dac502259ad0.png

相關(guān)矩陣分析為了減少數(shù)據(jù)集中的特征數(shù)量,另一種可能的方法是檢查特征與標(biāo)簽的相關(guān)性。使用皮爾遜相關(guān),我們的返回系數(shù)值將在-1 和 1 之間變化:
  • 如果兩個(gè)特征之間的相關(guān)性為 0,則意味著更改這兩個(gè)特征中的任何一個(gè)都不會影響另一個(gè)。

  • 如果兩個(gè)特征之間的相關(guān)性大于 0,這意味著增加一個(gè)特征中的值也會增加另一個(gè)特征中的值(相關(guān)系數(shù)越接近 1,兩個(gè)不同特征之間的這種聯(lián)系就越強(qiáng))。

  • 如果兩個(gè)特征之間的相關(guān)性小于 0,這意味著增加一個(gè)特征中的值將使減少另一個(gè)特征中的值(相關(guān)性系數(shù)越接近-1,兩個(gè)不同特征之間的這種關(guān)系將越強(qiáng))。

在這種情況下,我們將只考慮與輸出變量至少 0.5 相關(guān)的特性。
Numeric_df = pd.DataFrame(X)
Numeric_df['Y'] = Y
corr= Numeric_df.corr()
corr_y = abs(corr["Y"])
highest_corr = corr_y[corr_y >0.5]
highest_corr.sort_values(ascending=True)

1591ee84-6479-11ed-8abf-dac502259ad0.png

我們現(xiàn)在可以通過創(chuàng)建一個(gè)相關(guān)矩陣來更仔細(xì)地研究不同相關(guān)特征之間的關(guān)系。
figure(num=None, figsize=(12, 10), dpi=80, facecolor='w', edgecolor='k')


corr2 = Numeric_df[['bruises_f' , 'bruises_t' , 'gill-color_b' , 'gill-size_b' ,  'gill-size_n' , 'ring-type_p' , 'stalk-surface-below-ring_k' ,  'stalk-surface-above-ring_k' , 'odor_f', 'odor_n']].corr()


sns.heatmap(corr2, annot=True, fmt=".2g")

159a614a-6479-11ed-8abf-dac502259ad0.png

圖 6:最高相關(guān)特征的相關(guān)矩陣在這項(xiàng)分析中,另一個(gè)可能要控制的方面是檢查所選變量是否彼此高度相關(guān)。如果是的話,我們就只需要保留其中一個(gè)相關(guān)的,去掉其他的。最后,我們現(xiàn)在可以只選擇與 y 相關(guān)度最高的特征,訓(xùn)練/測試一個(gè)支持向量機(jī)模型來評估該方法的結(jié)果。

15aabbf8-6479-11ed-8abf-dac502259ad0.jpg

15b7b9c0-6479-11ed-8abf-dac502259ad0.png

單變量選擇單變量特征選擇是一種統(tǒng)計(jì)方法,用于選擇與我們對應(yīng)標(biāo)簽關(guān)系最密切的特征。使用 selectkbest 方法,我們可以決定使用哪些指標(biāo)來評估我們的特征,以及我們希望保留的 k 個(gè)最佳特征的數(shù)量。根據(jù)我們的需要,提供不同類型的評分函數(shù):
  • Classification = chi2, f_classif, mutual_info_classif

  • Regression = f_regression, mutual_info_regression

在本例中,我們將使用 chi2(圖 7)。

15c32b98-6479-11ed-8abf-dac502259ad0.png

圖 7:卡方公式 [4]卡方(chi-squared,chi2)可以將非負(fù)值作為輸入,因此,首先,我們在 0 到 1 之間的范圍內(nèi)縮放輸入數(shù)據(jù)。
from sklearn.feature_selection import SelectKBest
from sklearn.feature_selection import chi2


min_max_scaler = preprocessing.MinMaxScaler()
Scaled_X = min_max_scaler.fit_transform(X2)


X_new = SelectKBest(chi2, k=2).fit_transform(Scaled_X, Y)
X_Train3, X_Test3, Y_Train3, Y_Test3 = train_test_split(X_new, Y, test_size = 0.30,  random_state = 101)
start = time.process_time()
trainedforest = RandomForestClassifier(n_estimators=700).fit(X_Train3,Y_Train3)
print(time.process_time() - start)
predictionforest = trainedforest.predict(X_Test3)
print(confusion_matrix(Y_Test3,predictionforest))
print(classification_report(Y_Test3,predictionforest))

15cca8a8-6479-11ed-8abf-dac502259ad0.png

套索回歸當(dāng)將正則化應(yīng)用于機(jī)器學(xué)習(xí)模型時(shí),我們在模型參數(shù)上加上一個(gè)懲罰,以避免我們的模型試圖太接近我們的輸入數(shù)據(jù)。通過這種方式,我們可以使我們的模型不那么復(fù)雜,并且我們可以避免過度擬合(使我們的模型不僅學(xué)習(xí)關(guān)鍵的數(shù)據(jù)特征,而且學(xué)習(xí)它的內(nèi)在噪聲)。其中一種可能的正則化方法是套索回歸。當(dāng)使用套索回歸時(shí),如果輸入特征的系數(shù)對我們的機(jī)器學(xué)習(xí)模型訓(xùn)練沒有積極的貢獻(xiàn),則它們會縮小。這樣,一些特征可能會被自動丟棄,即將它們的系數(shù)指定為零。
from sklearn.linear_model import LassoCV


regr = LassoCV(cv=5, random_state=101)
regr.fit(X_Train,Y_Train)
print("LassoCV Best Alpha Scored: ", regr.alpha_)
print("LassoCV Model Accuracy: ", regr.score(X_Test, Y_Test))
model_coef = pd.Series(regr.coef_, index = list(X.columns[:-1]))
print("Variables Eliminated: ", str(sum(model_coef == 0)))
print("Variables Kept: ", str(sum(model_coef != 0)))

15d90d00-6479-11ed-8abf-dac502259ad0.png

一旦訓(xùn)練了我們的模型,我們就可以再次創(chuàng)建一個(gè)特征重要性圖來了解哪些特征被我們的模型認(rèn)為是最重要的(圖 8)。這是非常有用的,尤其是在試圖理解我們的模型是如何決定做出預(yù)測的時(shí)候,因此使我們的模型更易于解釋。
figure(num=None, figsize=(12, 10), dpi=80, facecolor='w', edgecolor='k')


top_coef = model_coef.sort_values()
top_coef[top_coef != 0].plot(kind = "barh")
plt.title("Most Important Features Identified using Lasso (!0)")

15e6b6bc-6479-11ed-8abf-dac502259ad0.png

圖 8:套索特征重要性圖 審核編輯:郭婷

聲明:本文內(nèi)容及配圖由入駐作者撰寫或者入駐合作網(wǎng)站授權(quán)轉(zhuǎn)載。文章觀點(diǎn)僅代表作者本人,不代表電子發(fā)燒友網(wǎng)立場。文章及其配圖僅供工程師學(xué)習(xí)之用,如有內(nèi)容侵權(quán)或者其他違規(guī)問題,請聯(lián)系本站處理。 舉報(bào)投訴
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    設(shè)計(jì)帶ADC電路時(shí),如何用模擬地與數(shù)字地進(jìn)行分割來減少數(shù)字地對模擬地的影響?

    我在設(shè)計(jì)帶ADC 電路時(shí),希望用模擬地與數(shù)字地進(jìn)行分割來減少數(shù)字地對模擬地的影響。但是,查詢一些資料得知推薦在ADC 的附近將數(shù)字地與模擬地進(jìn)行單點(diǎn)連接。 但是,數(shù)字地與模擬地難道不是應(yīng)該在總電源
    發(fā)表于 12-03 07:56

    使用Python進(jìn)行串口通信的案例

    當(dāng)然!以下是一個(gè)使用Python進(jìn)行串口通信的簡單示例。這個(gè)示例展示了如何配置串口、發(fā)送數(shù)據(jù)以及接收數(shù)據(jù)。我們將使用 pyserial 庫,這是一個(gè)非常流行的用于串口通信的Python
    的頭像 發(fā)表于 11-22 09:11 ?1469次閱讀

    樓宇集中控制照明系統(tǒng)

    在大型商業(yè)綜合體、辦公大樓等場所,照明設(shè)備數(shù)量眾多,分布廣泛,傳統(tǒng)的人工管理方式不僅耗時(shí)費(fèi)力,還容易出現(xiàn)疏漏。樓宇集中控制照明系統(tǒng),作為現(xiàn)代智能建筑和家居環(huán)境中的關(guān)鍵組成部分,通過集中管理、智能控制
    的頭像 發(fā)表于 11-21 16:44 ?580次閱讀

    對比Python與Java編程語言

    使得編寫代碼更加靈活,但也可能導(dǎo)致運(yùn)行時(shí)錯(cuò)誤。 Java 語法相對冗長,需要顯式聲明變量類型,增加了代碼的可讀性和安全性。 靜態(tài)類型系統(tǒng)在編譯時(shí)進(jìn)行類型檢查,減少了運(yùn)行時(shí)錯(cuò)誤。 二、性能 Python 解釋型語言,運(yùn)行速度通常比Java慢,但對于許多應(yīng)用場景
    的頭像 發(fā)表于 11-15 09:31 ?1106次閱讀

    怎么判斷需要集中補(bǔ)償還是分組補(bǔ)償

    判斷是否需要集中補(bǔ)償還是分組補(bǔ)償,主要取決于系統(tǒng)的負(fù)荷特性和補(bǔ)償?shù)哪康摹R韵率且恍╆P(guān)鍵因素: 1、負(fù)荷類型和分布 集中負(fù)荷:如果系統(tǒng)中的負(fù)荷較為集中,例如在一個(gè)大型車間或工廠內(nèi)的主要配
    的頭像 發(fā)表于 08-15 14:08 ?613次閱讀
    怎么判斷需要<b class='flag-5'>集中</b>補(bǔ)償還是分組補(bǔ)償

    使用Python批量連接華為網(wǎng)絡(luò)設(shè)備

    隨著網(wǎng)絡(luò)規(guī)模的擴(kuò)大和設(shè)備數(shù)量的增加,手動配置和管理每臺網(wǎng)絡(luò)設(shè)備變得越來越不現(xiàn)實(shí)。因此,自動化工具和腳本變得尤為重要。Python語言以其簡潔性和強(qiáng)大的第三方庫支持,成為了網(wǎng)絡(luò)自動化領(lǐng)域的首選。本篇文章將詳細(xì)介紹如何使用Python
    的頭像 發(fā)表于 08-12 17:48 ?912次閱讀

    pytorch和python的關(guān)系是什么

    在當(dāng)今的人工智能領(lǐng)域,Python已經(jīng)成為了最受歡迎的編程語言之一。Python的易學(xué)易用、豐富的庫和框架以及強(qiáng)大的社區(qū)支持,使其成為了數(shù)據(jù)科學(xué)、機(jī)器學(xué)習(xí)和深度學(xué)習(xí)等領(lǐng)域的首選語言。而在深度學(xué)習(xí)領(lǐng)域
    的頭像 發(fā)表于 08-01 15:27 ?3284次閱讀

    Python建模算法與應(yīng)用

    Python作為一種功能強(qiáng)大、免費(fèi)、開源且面向?qū)ο蟮木幊陶Z言,在科學(xué)計(jì)算、數(shù)學(xué)建模、數(shù)據(jù)分析等領(lǐng)域展現(xiàn)出了卓越的性能。其簡潔的語法、對動態(tài)輸入的支持以及解釋性語言的本質(zhì),使得Python在多個(gè)平臺
    的頭像 發(fā)表于 07-24 10:41 ?1268次閱讀

    Python在AI中的應(yīng)用實(shí)例

    Python在人工智能(AI)領(lǐng)域的應(yīng)用極為廣泛且深入,從基礎(chǔ)的數(shù)據(jù)處理、模型訓(xùn)練到高級的應(yīng)用部署,Python都扮演著至關(guān)重要的角色。以下將詳細(xì)探討Python在AI中的幾個(gè)關(guān)鍵應(yīng)用
    的頭像 發(fā)表于 07-19 17:16 ?2709次閱讀