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CADD在云超算平臺的運(yùn)用

Cloudam云端 ? 來源:Cloudam云端 ? 作者:Cloudam云端 ? 2022-12-14 10:40 ? 次閱讀
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CADD是計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)的縮寫,通常指使用計(jì)算機(jī)模擬技術(shù)來幫助化學(xué)家和生物醫(yī)學(xué)研究人員設(shè)計(jì)更有效的藥物分子。在云超算平臺上,CADD可以利用高性能計(jì)算能力來進(jìn)行大規(guī)模模擬和分析,提高藥物設(shè)計(jì)的效率和準(zhǔn)確性。例如,可以使用CADD來模擬藥物分子與靶分子之間的相互作用,預(yù)測藥物的活性和毒副作用,并優(yōu)化藥物分子的結(jié)構(gòu),以提高其治療效果??偟膩碚f,CADD在云超算平臺上的應(yīng)用可以幫助研究人員快速開發(fā)出更有效的藥物,推動醫(yī)藥研發(fā)的進(jìn)步。

由于CADD技術(shù)需要大量的計(jì)算資源,計(jì)算過程常常非常耗時(shí)。此外,CADD模擬的結(jié)果只能作為研究人員進(jìn)一步研究的參考,而不能作為結(jié)論。因此,CADD技術(shù)并不能完全取代傳統(tǒng)的實(shí)驗(yàn)方法,而是需要與實(shí)驗(yàn)相結(jié)合,才能更好地推動藥物研發(fā)。此外,CADD技術(shù)也受到數(shù)據(jù)質(zhì)量和數(shù)據(jù)訪問的限制,這可能對研究人員的工作造成一定的困難。

北鯤云CADD云平臺交付因云而生的高性能軟件,減輕科研人員的IT與工程負(fù)擔(dān)

具體怎么實(shí)現(xiàn)呢?

接入集成:SSH(SLURM)、RDP/VNC交互、WEB門戶、REST APIPython SDK

工作流編排:Molecular Screening、Molecular Dynamic、FEP、Quantum Chemistry、AI

核心能力:

HPC算力調(diào)度:CPU資源、GPU資源

HPC存儲管理:集中共享存儲、BurstFS IO加速、冷熱歸檔、自動擴(kuò)容

算子管理:軟件發(fā)布、算子定義、算子倉庫

工作流編排:流程編排、自定義流程、定制化集成

數(shù)據(jù)集中管理:數(shù)據(jù)傳輸、數(shù)據(jù)審批、備份歸檔、數(shù)據(jù)加密

安全運(yùn)維管理:網(wǎng)絡(luò)安全、數(shù)據(jù)安全、訪問審計(jì)

云平臺解決了哪些問題?

彈性算力溢出、加速計(jì)算過程、多地域/部門協(xié)同、保障數(shù)據(jù)安全

更賦能更多藥物發(fā)現(xiàn)場景,如:

構(gòu)建HPC&AI環(huán)境,徹底解決算力不足問題

利用云計(jì)算進(jìn)行大規(guī)模模擬

藥企構(gòu)建CADD/AIDD平臺

對外服務(wù)平臺的底層算力與工作流接入底座

同ISV整合形成一體化交付方案

縮短時(shí)間、自動編排、并行規(guī)模、整合拓展都是北鯤云CADD云平臺能做到的,歡迎大家了解。

審核編輯黃昊宇








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