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信噪比:高端科研級相機(jī)的核心參數(shù)

jf_64961214 ? 來源:jf_64961214 ? 作者:jf_64961214 ? 2023-05-31 07:08 ? 次閱讀
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如果從成像結(jié)果來考察一款科研相機(jī),最重要的一般有3個特征:

(1)黑白還是彩色。彩色相機(jī)能帶來顏色信息,但靈敏度和分辨率都不及同參數(shù)的黑白相機(jī)。

(2)幀速。無論是高速移動的樣品還是一閃而過的光信號,都需要高幀速相機(jī)才有可能采集到。

(3)成像質(zhì)量。影響成像質(zhì)量(或者經(jīng)常聽到"清晰度"這樣的口頭表述)的因素,包括信噪比和分辨率。無論是信噪比過低,還是分辨率過低,都無法得到讓人滿意的圖片(如圖1)。

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圖1. 信噪比和分辨率對成像質(zhì)量的影

本文主要討論信噪比。

信噪比公式及解析

在相機(jī)的成像過程中,除了真實(shí)的信號,還會引入一系列的不確定性(光信號本身的不確定性、材料熱運(yùn)動,電子學(xué)噪聲等等)——稱為噪聲。而信號與噪聲的比值被定義為信噪比(Signal-to-Noise Ratio, SNR)。

相機(jī)的信噪比可以通過如下公式計(jì)算得出:

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圖2. 信噪比公式

公式中的分子部分就是"信號",單位時間的入射光子數(shù)目(P,即信號的強(qiáng)度)乘以曝光時間(t),即為入射光子的總數(shù)目,其中有一定比例(QE,量子效率)被相機(jī)轉(zhuǎn)換為電荷,最終稱為相機(jī)成像的"信號"。

公式中的分母部分是"噪聲",分成三個組成部分。

(1)第一個部分是來自"真實(shí)信號"的散粒噪聲——√P·QE·t. ( 如何理解這個"散粒噪聲"呢?比如原始的光信號對應(yīng)每秒鐘100個光子落到一個像素上,但實(shí)際的情況卻有可能是第一個一秒鐘,落下了97個光子;第二個一秒鐘落下了104個光子;第三個一秒鐘落下來101個光子;等等等等。這種不確定性就是散粒噪聲的來源。

(2)第二個部分是來自暗電流的散粒噪聲——√D·t.由于相機(jī)的芯片是Si(或者InGaAs等其他材料),只要不是絕對零度,電子的熱運(yùn)動都會有幾率被當(dāng)成"信號"讀出——稱之為暗電流。暗電流可以隨著時間而積累。雖然暗電流是可能通過后期算法給扣除的,但是其不確定性,或者說來自于暗電流的散粒噪聲卻無法消除。

(3)第三個部分是讀出噪聲——R。讀出噪聲的來源很多,實(shí)際操作中,將相機(jī)的蓋子關(guān)閉(即沒有任何光信號),采用最短的曝光時間(盡可能排除暗電流/暗噪聲的影響)所得到的圖像中的像素值的不確定性就被記為讀出噪聲。讀出噪聲是一個籠統(tǒng)但是很有實(shí)用性的概念——尤其在高速弱光成像中,因?yàn)榇藭r曝光時間很短,所以暗電流/暗噪聲都很小,主要的噪聲來源就是讀出噪聲。

由于以上三種噪聲來源互不相關(guān),所以總噪聲就等于其平方和再取平方根。

對于特定的拍攝條件,讀出噪聲和暗電流都是固定的。所以信號越強(qiáng),其散粒噪聲也越大,成為噪聲的主要來源。此時信噪比公式可以近似為:

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圖3. 信號較強(qiáng)時的近似信噪比公式

但如果信號很弱,來自信號的散粒噪聲就很小,此時讀出噪聲和暗電流的影響就不能忽略。

那么,如果希望提升相機(jī)成像的信噪比,改善信號較弱時的成像質(zhì)量,我們能夠從上面的信噪比公式中得到怎樣的啟發(fā)呢?大致說來有6個方面。

# 影響信噪比的因素(1)——曝光時間

無論是從大家日常的理解還是從信噪比公式中,我們都很容易得出曝光時間(t)越長,信噪比越高的結(jié)論。

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圖4. 曝光時間與信噪比的關(guān)系

然而,曝光時間長了,幀速就無法得到保障。曝光時間為1 s的時候,無論如何幀速也是無法超過1幀/秒的。

所以,曝光時間的延長能夠提升信噪比,但是會損失幀速。

# 影響信噪比的因素(2)——光學(xué)系統(tǒng)的素質(zhì)

對于同一樣品發(fā)出的信號,光學(xué)系統(tǒng)直接影響到落到相機(jī)上的光信號強(qiáng)度(即公式中的"P")。對于顯微成像而言,最常見的的提升方式就是選擇更好的物鏡;一般而言,數(shù)值孔徑(NA)越大,物鏡對信號的收集能力越強(qiáng)。

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圖5. 不同數(shù)值孔徑(NA)的物鏡對成像效果的影響。(a) Plan 20×/0.4 NA; (b) UPlanFL N 20×/0.5 NA; (c) UPlanSApo 20×/0.75 NA.(參考用圖,如若侵權(quán)請聯(lián)系刪除)

小結(jié):用你能得到的最好的光學(xué)系統(tǒng)

# 影響信噪比的因素(3)——像素尺寸

像素尺寸也是影響信噪比公式中的"P"(入射的光子數(shù)目);像素尺寸越大,落到一個像素上的光子就越多。在其他參數(shù)都一致的情況下,信噪比自然就越高。但過大的像素尺寸會損失相機(jī)的分辨率。

簡而言之,在不調(diào)節(jié)光路僅僅更換相機(jī)的情況下(這是非常常見的場景),采用更大像素尺寸的相機(jī)在增加信噪比的同時往往會降低圖像的分辨率(如圖6)。

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圖6. 不同像素尺寸相機(jī)對同一樣品的成像效果對比。樣品為直徑1μm的熒光小球,放大倍數(shù)60X

# 影響信噪比的因素(4)——制冷與暗電流

由于暗電流(信噪比公式中的"D")來源于材料中電子的熱運(yùn)動,所以芯片溫度越高,暗電流越大;對于同一芯片,近似的規(guī)律是溫度每下降10度,暗電流減小一半。

當(dāng)前市場上的中高端科研相機(jī)的暗電流通常都很小,在1 s以下曝光時間時,暗噪聲相比于讀出噪聲通??梢院雎浴5捎诎惦娏麟S曝光時間會積累,所以越是長曝光時間的應(yīng)用,制冷就越重要。

在實(shí)際選型中,不同類型的相機(jī)對制冷的要求也不盡相同:

(1)對于EMCCD相機(jī),像素尺寸通常較大(常見的為13-16 μm),每個像素上產(chǎn)生的暗電流本就較多,而且EMCCD中的暗電流還會和信號一起被增益放大,所以用制冷壓制EMCCD相機(jī)的暗電流產(chǎn)生尤其重要。因?yàn)檫@些原因,主流的EMCCD相機(jī)制冷溫度都在-50 ℃以下。

(2)而對于sCMOS相機(jī),不僅像素尺寸會較小一些(常見的為6.5 μm),也沒有額外的增益,所以對制冷的要求就相對低一點(diǎn)。

從圖7中可以看到,在sCMOS相機(jī)中,制冷溫度的具體高低影響不是那么明顯,但有沒有制冷對暗噪聲的表現(xiàn)影響很大(圖7-A是沒有制冷的相機(jī),圖7-B,C,D都是有制冷的)。這是因?yàn)椋坏]有制冷,相機(jī)的芯片工作溫度并不是簡單的室溫,而通常高達(dá)60-70 ℃,在長時間曝光中(如圖7中的10 s曝光時間),其暗電流自然就會高到不可忽視。

筆者在平時工作中,就曾經(jīng)有過兩個有趣的相關(guān)經(jīng)歷。第一個是剛接觸科研相機(jī)時,看到許多諸如室溫下10 ℃(-10 ℃ from ambient temperature)的相機(jī),表示不可理解,覺得"就10度的制冷,這有啥用?"。第二個是濱松有一款面向產(chǎn)業(yè)客戶的板級sCMOS相機(jī)C11440-62U,其制冷溫度為室溫上10 ℃(+10℃ from ambient temperature),剛看到參數(shù)的時候也是小小疑惑了一把。其實(shí)當(dāng)年產(chǎn)生這樣的疑惑,就是因?yàn)闆]有意識到如果相機(jī)沒有制冷,實(shí)際的工作溫度將遠(yuǎn)超室溫這一點(diǎn)。

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圖7. 冷卻對相機(jī)的影響。四張圖片來自于四臺相機(jī),均采用10 s的曝光時間,LUT設(shè)置成一樣。這四臺相機(jī)采用了同樣的芯片,但制冷溫度不同。從左至右依次為:(a) 沒有制冷(C11440-52U);(b) 制冷溫度為10 ℃(C11440-42U);(c) 制冷溫度為-10 ℃(C11440-22CU,風(fēng)冷模式);(d) 制冷溫度為-20 ℃(C11440-22CU,水冷模式)

小結(jié):對于當(dāng)今的高端相機(jī),只要有制冷,暗電流都很小。

# 影響信噪比的因素(5)——量子效率

量子效率(即信噪比中的QE)為光子在相機(jī)像素上轉(zhuǎn)換成為電子的比例。同樣是100個光子落到一個像素上,QE 82%意味著相機(jī)能夠轉(zhuǎn)換得到82個電子;QE 72%則代表能轉(zhuǎn)換得到72個電子。顯然,QE越高,相機(jī)的信噪比越高。

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圖8. 量子效率對信噪比的影響

有關(guān)QE,看參數(shù)時需要特別注意以下兩點(diǎn):

(1)QE與波長是有關(guān)的,對于同一臺相機(jī),不同波長的QE并不相同。以O(shè)RCA-Flash 4.0 V3為例,在600nm的紅光處其QE為最高的82%,在900 nm的紅外光處就只剩下了25%左右。

(2)一般我們在高端科研相機(jī)的參數(shù)表中看到的都是量子效率峰值——也就是相機(jī)最靈敏的波長所對應(yīng)的QE。但是,不同相機(jī)/芯片的量子效率峰值所對應(yīng)的波長并不一樣,所以如果確切的直到自己信號的波長/顏色,最好能夠確認(rèn)下相機(jī)在對應(yīng)波長下的QE,而不是簡單地比較量子效率峰值。

如圖9中左圖所示,ORCA-Spark的峰值波長在450-500 nm之間,QE峰值為80%;而Flash 4.0 LT的峰值波長在550-600 nm之間,QE峰值為72%。雖然ORCA-Spark的量子效率峰值更高,但如果針對紅色熒光,F(xiàn)lash 4.0 LT的QE反而更好。

小結(jié):QE很重要,但QE峰值更多是個參考,查到關(guān)注波長的QE值非常關(guān)鍵。

# 影響信噪比的因素(6)——讀出噪聲(R)

在信號較弱的成像中,來自信號的散粒噪聲較?。欢惦娏鞯纳⒘T肼暎窗翟肼暎┰诋?dāng)前的高端科研相機(jī)都是很低的,在曝光時間1s這個量級甚至更短的時候,暗噪聲通??梢院雎?;此時讀出噪聲(即信噪比公式中的"R")就稱為特別需要考量的因素了。

對于同樣的芯片,讀出噪聲的大小與讀出速度有關(guān),無論對于CCD相機(jī)還是sCMOS相機(jī),讀出速度越快,讀出噪聲越高。而sCMOS相對于CCD的一個核心優(yōu)勢,就是高速讀出時依然能夠保持極低的讀出噪聲。

讀出噪聲的重要性也使得其和QE一起變成了相機(jī)被重點(diǎn)關(guān)注的兩個參數(shù)。單純考察兩者中的一個優(yōu)勢并不能正確預(yù)測成像的信噪比。如圖9所示,同樣拍一個綠色熒光樣品,QE較高的ORCA-Spark成像質(zhì)量卻不如ORCA-Flash 4.0 LT,就是因?yàn)镺RCA-Flash 4.0 LT的讀出噪聲較低,綜合考慮時ORCA-Flash 4.0 LT的信噪比更好。

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圖9. 讀出噪聲對信噪比的影響

小結(jié):如果用于弱信號探測,相機(jī)的讀出噪聲對于總體的信噪比很重要。

審核編輯黃宇

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