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一種用于液體活檢生物標(biāo)志物(ctDNA)檢測的微流控芯片

TEL13810205352 ? 來源:POCT分子診斷 ? 2024-03-11 13:53 ? 次閱讀
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本文基于離心芯片采用由表面張力輔助的不混溶性結(jié)構(gòu)實(shí)現(xiàn)全血中 cfDNA 的提取。整個(gè)操作過程小于 15 min,從血漿中回收的cfDNA為 65%,從全血中回收的為 30%。

液體活檢簡述見揭開液體活檢技術(shù)的神秘面紗(附視頻)

如圖 1 所示,直徑 100 mm 芯片由兩部分組成:一部分用于血漿分離和轉(zhuǎn)移,另一部分用于核酸分離。 其中,血漿分離是基于離心法實(shí)現(xiàn)的;一個(gè)漏斗狀的腔室被用于血漿提取,該腔可容納 4 mL 全血。在虹吸通道中設(shè)計(jì)有空氣閥,避免在采樣過程中血液在毛細(xì)管作用下進(jìn)入樣品腔。

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圖 1

cfDNA 的提取和純化如圖 2 所示;腔室間通過拱狀毛細(xì)管微通道相互連接,其中微通道高度為 200 μm,寬度從 400 μm 到 3 mm 不等。該結(jié)構(gòu)的關(guān)鍵是確保整個(gè)過程中所有相的不混溶性,并確保在磁珠轉(zhuǎn)移過程中形成穩(wěn)定的界面。

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圖 2

鑒于此,本文設(shè)計(jì)了一個(gè)用于不混溶相中磁珠轉(zhuǎn)移的拱狀通道(圖 2 放大圖)。根據(jù)表面張力在微尺度上的主導(dǎo)作用,一個(gè)虛擬的 水-空氣“墻”和 空氣-油“墻” 形成,以避免在芯片靜止期間 (樣品加載和磁珠轉(zhuǎn)移時(shí))水和油的混合。

其它類似結(jié)構(gòu)見迷你樣品進(jìn)結(jié)果出核酸檢測儀(附視頻)

為了提高旋轉(zhuǎn)過程中不混溶相界面的強(qiáng)度,對(duì)空氣微腔表面進(jìn)行聚四氟乙烯處理 (Teflon treatment),降低表面能,增加空氣介質(zhì)表面與水/油界面的張力。

在芯片啟動(dòng)加速過程中,微通道中形成了不混溶相的界面。如果角加速度過大,則當(dāng)不混溶相界面兩側(cè)的壓差超過表面張力,不混溶相界面將被破壞。

芯片實(shí)物圖如圖 3 所示。

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圖 3

磁珠在外磁場作用下連續(xù)通過幾個(gè)不混溶界面。在磁珠轉(zhuǎn)移過程中,磁珠在外部磁力的作用下凝聚成團(tuán)。如果磁力克服界面張力,磁珠就能穿過界面。

芯片中各個(gè)腔室尺寸如圖 4 所示。

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圖 4

圖 5 所示為芯片制作流程;首先由 CNC 加工模具,然后將 PDMS 涂在模具上,隨后剝離粘接在玻璃片上。

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圖5

樣品加載過程如下:首先,將 4 ml 全血 (摻有 HBV 片段短 DNA) 加載到血漿分離腔中;然后將 15 μl二氧化硅包被的磁珠,1.25 ml裂解/結(jié)合緩沖液,50 μl 的洗脫液注入對(duì)應(yīng)的腔室。最后將硅油注入400 μl不混溶相腔。

本文采用硅油替代 FC-40 等氟化油是由于氟化油會(huì)導(dǎo)致氣腔表面處理的聚四氟乙烯溶解。

對(duì)于血漿分離,芯片首先被緩慢加速到一個(gè)特定的速度 (120 rpm),以保持穩(wěn)定的不混相界面。然后將芯片加速到 3600 rpm,持續(xù) 4 min。在細(xì)胞沉降后,芯片在減速期間激活虹吸閥。隨后,分離的1.6 ml血漿樣本被離心到血漿收集腔,用于后續(xù) cfDNA 提取。

提取到血漿后,芯片開始進(jìn)行核酸提取。采用加減速將磁珠、血漿,和裂解/結(jié)合緩沖液混合,以高效地將 cfDNA 結(jié)合到磁珠表面。

隨后移動(dòng)外部磁鐵,將磁珠穿過不混溶相進(jìn)入洗脫緩沖液中。此時(shí),純化的 cfDNA 就被帶入洗脫腔。再次采用加減速混合將核酸從磁珠表面洗脫。最后收集洗脫腔上清液用于下游檢測。如采用 定量 PCR 或數(shù)字 PCR。

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圖 6

芯片首先以較低的角速度 (10 rpm/s) 啟動(dòng),以保護(hù)不混溶相界面不發(fā)生混溶。當(dāng)角速度增加到一個(gè)特定的值(120 rpm)時(shí),不混溶相液體離開微通道進(jìn)入腔室。然后,在 500 rpm/s 的加速度下升至 3600 rpm ,持續(xù) 4 min 實(shí)現(xiàn)血漿分離 (圖 6)。

在血漿分離腔的底部,設(shè)計(jì)了指狀結(jié)構(gòu)有助于分散芯片旋轉(zhuǎn)期間產(chǎn)生的離心壓力。

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圖 7

血漿分離后,芯片以 50 rpm/s 的減速度減至 350 rpm 激活虹吸閥,然后,以 20 rpm/s 的加速度至600 rpm轉(zhuǎn)移 1.6 ml血漿到 cfDNA 提取腔(圖 7)。

隨后,進(jìn)行 cfDNA 提取。芯片首先在120 - 840 rpm 之間進(jìn)行加減速混合,持續(xù) 150 s 實(shí)現(xiàn) 磁珠、血漿,和裂解/結(jié)合緩沖液混合。之后手持磁鐵以~5mm/s 的速度手動(dòng)移動(dòng),將腔室內(nèi)磁珠穿過不混溶的屏障進(jìn)入洗脫腔。

然后,再次在120 - 840 rpm 之間進(jìn)行加減速混合,以充分洗脫核酸。

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圖 8

在血漿提取時(shí),離心速度不能太快;如果速度太快,血細(xì)胞可能會(huì)破裂,導(dǎo)致內(nèi)部物質(zhì)釋放出來,即所謂的 溶血。

在血漿分離過程中是否發(fā)生溶血現(xiàn)象,不僅取決于離心速度,還取決于離心時(shí)間。因此,合理的離心速度和時(shí)間是極其重要的。

低離心速度和短離心時(shí)間可能導(dǎo)致分離不充分,而高離心速度和長離心時(shí)間可能引起溶血現(xiàn)象。

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圖9

附錄

什么是溶血?

溶血是指紅血細(xì)胞(也稱為紅細(xì)胞或血球)在一定條件下破裂和釋放其內(nèi)部的血紅蛋白和其他細(xì)胞成分的過程。這通常發(fā)生在紅細(xì)胞受到物理、化學(xué)或生物學(xué)上的壓力或損傷時(shí)。溶血可以在體內(nèi)或體外發(fā)生,具體取決于引發(fā)溶血的原因。

在體內(nèi),溶血可能由各種原因引起,如遺傳性貧血癥、自身免疫性疾病、藥物反應(yīng)、感染等。在體外,溶血通常涉及實(shí)驗(yàn)室操作或臨床檢測,如血液分離、儲(chǔ)存和輸送過程中的意外損傷。

溶血會(huì)導(dǎo)致血紅蛋白釋放到血漿中,這可能對(duì)機(jī)體產(chǎn)生負(fù)面影響,因?yàn)檠t蛋白可以引起腎臟損害和其他并發(fā)癥。在臨床和實(shí)驗(yàn)室環(huán)境中,控制溶血是非常重要的,以確保血液樣本和制備的產(chǎn)物的質(zhì)量和完整性。

判斷是否發(fā)生溶血通常涉及對(duì)血液樣本或液體中的特定指標(biāo)進(jìn)行分析和觀察。以下是幾種常見的方法來判斷是否發(fā)生了溶血現(xiàn)象:

顏色變化:溶血通常會(huì)導(dǎo)致液體從紅色變成粉紅色或透明,這是因?yàn)獒尫懦龅难t蛋白會(huì)影響液體的顏色。

吸光度測量:在實(shí)驗(yàn)室環(huán)境中,可以使用分光光度計(jì)來測量液體的吸光度。溶血會(huì)導(dǎo)致液體中血紅蛋白的濃度增加,從而使吸光度值升高。

紅細(xì)胞計(jì)數(shù)和形態(tài)觀察:可以使用顯微鏡觀察血液樣本中的紅細(xì)胞數(shù)量和形態(tài)。溶血可能導(dǎo)致紅細(xì)胞數(shù)量減少,同時(shí)紅細(xì)胞的形態(tài)也可能發(fā)生改變。

血紅蛋白測量:使用血紅蛋白測量方法,如比色法或電化學(xué)法,可以測定液體中的血紅蛋白濃度。溶血會(huì)導(dǎo)致血紅蛋白濃度升高。

血漿游離血紅蛋白測定:溶血會(huì)釋放血漿中的游離血紅蛋白。通過測量游離血紅蛋白的濃度,可以判斷是否發(fā)生了溶血。

細(xì)胞膜標(biāo)記物測定:可以通過測量紅細(xì)胞膜上的特定標(biāo)記物的濃度,如LDH(乳酸脫氫酶)和鉀離子,來判斷紅細(xì)胞是否受損和是否發(fā)生了溶血。




審核編輯:劉清

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原文標(biāo)題:一種用于液體活檢生物標(biāo)志物(ctDNA)檢測的微流控芯片

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