資料介紹
遺傳算法的生物學(xué)基礎(chǔ)
生物在自然界中的生存繁衍,顯示出了其對自然環(huán)境的自適應(yīng)能力。受其啟發(fā),
人們致力于對生物各種生存特性的機理研究和行為模擬,為人工自適應(yīng)系統(tǒng)的設(shè)計
和開發(fā)提供了廣闊的前景。遺傳算法(Genetic Algorithms,簡稱GAs)就是這種生物
行為的計算機模擬中令人矚目的重要成果?;趯ι镞z傳和進化過程的計算機模
擬,遺傳算法使得各種人工系統(tǒng)具有優(yōu)良的自適應(yīng)能力和優(yōu)化能力。
遺傳算法所借鑒的生物學(xué)基礎(chǔ)就是生物的遺傳和進化。
1.1.1 遺傳與變異
遺傳(Heredity)—— 世間的生物從其父代繼承特性或性狀,這種生命現(xiàn)象就稱為
遺傳(Heredity),由于遺傳的作用,使得人們可以種瓜得瓜、
種豆得豆,也使得鳥仍然是在天空中飛翔,魚仍然是在水中邀
游。
• 構(gòu)成生物的基本結(jié)構(gòu)和功能的單位是細胞(Ce11)。
• 細胞中含有的一種微小的絲狀化合物稱為染色體(Chromosome),生物的所有遺
傳信息都包含在這個復(fù)雜而又微小的染色體中。
• 基因
經(jīng)過生物學(xué)家的研究,控制并決定生物遺傳性狀的染色體主要是由一種叫做脫
氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid 簡稱DNA)的物質(zhì)所構(gòu)成。 DNA在染色體中有
規(guī)則地排列著,它是個大分子的有機聚合物,其基本結(jié)構(gòu)單位是核苷酸,許多核苷
酸通過磷酸二酯鍵相結(jié)合形成一個長長的鏈狀結(jié)構(gòu),兩個鏈狀結(jié)構(gòu)再通過堿基間的氫鍵有
規(guī)律地扭合在一起,相互卷曲起來形成一種雙螺旋結(jié)構(gòu)。基因就是DNA長鏈結(jié)構(gòu)中占有一
定位置的基本遺傳單位。
• 遺傳信息是由基因(Gene)組成的,生物的各種性狀由其相應(yīng)的基因所控制。
• 基因是遺傳的基本單位。細胞通過分裂具有自我復(fù)制的能力,在細胞分裂的過
程中,其遺傳基因也同時被復(fù)制到下一代,從而其性狀也被下一代所繼承。
• 遺傳基因在染色體中所占據(jù)的位置稱為基因座(Locus);
• 同一基因座可能有的全部基因稱為等位基因(Allele);
• 某種生物所特有的基因及其構(gòu)成形式稱為該生物的基因型(Genotype);
• 而該生物在環(huán)境中呈現(xiàn)出的相應(yīng)的性狀稱為該生物的表現(xiàn)型(Phenotype);
• 一個細胞核中所有染色體所攜帶的遺傳信息的全體稱為一個基因組(Genome)
生物的遺傳方式:
1. 復(fù)制
生物的主耍遺傳方式是復(fù)制。遺傳過程中,父代的遺傳物質(zhì)DNA被復(fù)制到子
代。即細胞在分裂時,遺傳物質(zhì)DNA通過復(fù)制(Reproduction)而轉(zhuǎn)移到新生的細
胞中,新細胞就繼承了舊細胞的基因。
2. 交叉
有性生殖生物在繁殖下一代時,兩個同源染色體之間通過交叉(Crossover)而重
組,亦即在兩個染色體的某一相同位置處DNA被切斷,其前后兩串分別交義組合
而形成兩個新的染色體。
3. 變異
在進行細胞復(fù)制時,雖然概率很小,僅僅有可能產(chǎn)生某些復(fù)制差錯,從而使
DNA發(fā)生某種變異(Mutation),產(chǎn)生出新的染色體。這些新的染色體表現(xiàn)出新的
性狀。
如此這般,遺傳基因或染色體在遺傳的過程中由于各種各樣的原因而發(fā)生變化。1.1.2 進化
地球上的生物,都是經(jīng)過長期進化而形成的。根據(jù)達爾文的自然選擇學(xué)說,地
球上的生物具有很強的繁殖能力。在繁殖過程中,大多數(shù)生物通過遺傳,使物種
保持相似的后代;部分生物由于變異,后代具有明顯差別,甚至形成新物種。正
是由于生物的不斷繁殖后代,生物數(shù)目大量增加,而自然界中生物賴以生存的資
源卻是有限的。因此,為了生存,生物就需要競爭。生物在生存競爭中,根據(jù)對
環(huán)境的適應(yīng)能力,適者生存,不適者消亡。自然界中的生物,就是根據(jù)這種優(yōu)勝
劣汰的原則,不斷地進行進化。
• 生物的進化是以集團的形式共同進行的,這樣的一個團體稱為群體(Population),
或稱為種群。
• 組成群體的單個生物稱為個體(Individual),
• 每一個個體對其生存環(huán)境都有不同的適應(yīng)能力,這種適應(yīng)能力稱為個體的適應(yīng)度(Fitness)。
1.1.3 遺傳與進化的系統(tǒng)觀
雖然人們還未完全揭開遺傳與進化的奧秘,即沒有完全掌握其機制、也不完全
清楚染色體編碼和譯碼過程的細節(jié),更不完全了解其控制方式,但遺傳與進化的
以下幾個特點卻為人們所共識:
(1) 生物的所有遺傳信息都包含在其染色體中,染色體決定了生物的性狀;
(2) 染色體是由基因及其有規(guī)律的排列所構(gòu)成的,遺傳和進化過程發(fā)生在染色體上;
(3) 生物的繁殖過程是由其基因的復(fù)制過程來完成的;
(4) 通過同源染色體之間的交叉或染色體的變異會產(chǎn)生新的物種,使生物呈現(xiàn)新的
性狀。
(5) 對環(huán)境適應(yīng)性好的基因或染色體經(jīng)常比適應(yīng)性差的基因或染色體有更多的機會
遺傳到下一代。
1.2 遺傳算法簡介
遺傳算法是模擬生物在自然環(huán)境下的遺傳和進化過程而形成的一種自適應(yīng)全局
優(yōu)化概率搜索方法。
它最早由美國密西根大學(xué)的H.Holland教授提出,起源于60年代對自然和人工
自適應(yīng)系統(tǒng)的研究;
1967年,Bagley發(fā)表了關(guān)于遺傳算法應(yīng)用的論文,在其論文中首次使用“遺傳算法( Genetic Algorithm)”一詞。
70年代 De Jong基于遺傳算法的思想在計算機上進行了大量的純數(shù)值函數(shù)優(yōu)化
計算實驗。
在一系列研究工作的基礎(chǔ)上,80年代由Goldberg進行歸納總結(jié),形成了遺傳算法的基本框架。
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