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Intel、聯(lián)想以及華大基因宣布將共同推進新型冠狀病毒基因組特性分析

工程師鄧生 ? 來源:快科技 ? 作者:朝暉 ? 2020-03-04 09:16 ? 次閱讀
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今日,Intel、聯(lián)想以及華大基因今天宣布,三家公司正攜手加快COVID-19新型冠狀病毒的基因組特性分析。

據(jù)悉,來自Intel及聯(lián)想的專業(yè)技術與生命科學專家將通力合作,為華大基因的研究人員提供全新的大數(shù)據(jù)分析技術和計算資源,進一步提升其基因測序工具的分析能力,更高效地研究新型冠狀病毒的基因組特性。

Intel和聯(lián)想攜手為華大基因提供的技術包括一個大型高性能計算集群,可用于處理從華大DNBSEQ-T7 測序系統(tǒng)讀取的高通量數(shù)據(jù)。

華大基因的研究人員將能夠通過全新的高性能計算和基因組分析技術,以及Intel和聯(lián)想的相關資源和專業(yè)知識,進一步加速他們對新型冠狀病毒的基因組特性研究。

該技術將支持科學家研究病毒的毒性、傳播模式、病原體與宿主間的相互作用,進而助力流行病學及疫苗設計研究。這些工作對于未來創(chuàng)建更好的診斷方法和設計有效的疫苗或其他保護性措施(例如免疫療法)是非常必要的。

通過這項合作,華大基因?qū)⒌靡岳^續(xù)優(yōu)化其新型冠狀病毒檢測試劑盒并獲取大量有價值的信息。這些信息將有助于確定將來開發(fā)有效疫苗或治療方法的潛在靶標。

通過Intel和聯(lián)想的共同努力,聯(lián)想的超算技術支持并優(yōu)化了“基因組優(yōu)化和可擴展性工具”,(簡稱GOAST,首個獲得Intel精選解決方案驗證的基因組分析工具),可為全基因組測序和全外顯子測序的計算提供高達40倍的加速,助力華大基因優(yōu)化計算過程,高效處理數(shù)據(jù),更快地生成可靠的基因組分析成果,從而縮短科研和臨床觀察的時間。

“目前我們對這個新型冠狀病毒還有很多不了解的地方。華大基因通過分析病毒基因組數(shù)據(jù),加速對感染者的快速識別和基因組特性的研究,而這些工作需要投入巨大的計算資源,這恰恰是我們可以發(fā)揮作用的地方?!?/p>

Intel公司市場營銷集團副總裁兼中國區(qū)總經(jīng)理王銳表示,“因此,我們緊密攜手,為正在防疫一線進行病毒研究的科學家提供更多的計算資源和專業(yè)支持,希望與狡猾的病毒賽跑,助力疫情防控,拯救更多生命?!?/p>

據(jù)了解,在基因測序工作中,每毫升體液通常會包含數(shù)百萬個不同的病毒體,而每個病毒體的基因組則包含大約30,000個DNA堿基或字母。

華大基因正在對許多感染患者和疑似感染患者的微生物進行基因測序,因此這些研究工作將會生成TB級乃至PB級的海量數(shù)據(jù)。要想高效地快速處理這些重要數(shù)據(jù),就需要采用更為先進的HPC基礎架構、計算技術以及優(yōu)化的基因組分析方法。

責任編輯:wv

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