生物計(jì)算領(lǐng)域的年度標(biāo)桿會議。

5月10日，由百圖生科與播禾創(chuàng)新聯(lián)合主辦的「首屆中國生物計(jì)算大會」在蘇州國際博覽中心召開。本次大會邀請到了包括6位院士在內(nèi)的50余位專家學(xué)者、40余位生物醫(yī)藥企業(yè)高管到會分享，1500余名觀眾在現(xiàn)場參加了會議，首日直播線上觀看人數(shù)超過51.2萬。

作為本次大會的協(xié)辦媒體，雷鋒網(wǎng)《醫(yī)健AI掘金志》進(jìn)行了全程報(bào)道。大會首日上午，以《BT&IT的融合生態(tài)》為主題的主論壇首先召開，江蘇省委常委、蘇州市委書記許昆林和百度創(chuàng)始人、董事長兼CEO，百圖生科創(chuàng)始人兼董事長李彥宏分別作了精彩致辭。

許昆林在致辭中表示：蘇州正在緊盯新一輪的產(chǎn)業(yè)革命，做強(qiáng)戰(zhàn)略性新興產(chǎn)業(yè)。以生物計(jì)算為例，2020年蘇州新一代生物技術(shù)、納米技術(shù)、人工智能等產(chǎn)業(yè)產(chǎn)值8718億元，生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)綜合競爭力位列產(chǎn)業(yè)第二，產(chǎn)業(yè)競爭力位于第一。此外，蘇州目前還獲得了全國唯一一個(gè)國家科技部的國家生物藥技術(shù)創(chuàng)新中心牌照。未來，蘇州也會依托國家生物醫(yī)藥技術(shù)創(chuàng)新中心，和國家新一代人工智能創(chuàng)新發(fā)展試驗(yàn)區(qū)平臺，開展生物計(jì)算的交叉學(xué)科布局。

除了是百度公司的董事長，李彥宏重申了自己的新身份：百圖生科的創(chuàng)始人。他表示，生物計(jì)算是個(gè)高度融合的學(xué)科，生物+計(jì)算的融合，會帶來巨大的突破和進(jìn)步。依靠生物計(jì)算引擎，能夠有效利用大量的生物數(shù)據(jù)，把藥物發(fā)現(xiàn)的“大海撈針”變成“按圖索驥”，為人類的生命健康謀福祉。“我們希望用AI技術(shù)，縮短藥物研發(fā)的時(shí)間，降低藥物的副作用，減輕患者的巨大醫(yī)療負(fù)擔(dān)，為每一個(gè)生命爭取更多的可能性。”李彥宏發(fā)現(xiàn)，這些年生物計(jì)算的發(fā)展和當(dāng)初互聯(lián)網(wǎng)信息領(lǐng)域的高速發(fā)展驚人相似。搜索量的增長被三個(gè)因素驅(qū)動，第一是上網(wǎng)人數(shù)，第二是人均上網(wǎng)時(shí)間，第三就是網(wǎng)上存在的網(wǎng)頁數(shù)量。

而他發(fā)現(xiàn)，生物計(jì)算領(lǐng)域也同樣有三個(gè)關(guān)鍵指標(biāo)在快速增長，分別是基因組學(xué)研究帶來的數(shù)據(jù)增長，新藥研發(fā)過程中積累的知識爆發(fā)，以及新生機(jī)器學(xué)習(xí)算法的快速變化。生物計(jì)算產(chǎn)業(yè)的發(fā)展，需要生態(tài)和產(chǎn)業(yè)鏈的協(xié)同，構(gòu)建開放的生物計(jì)算創(chuàng)新生態(tài)，去探索廣袤浩瀚的生命科學(xué)“無人區(qū)”。李彥宏表示：“在生命健康這個(gè)最關(guān)鍵的領(lǐng)域，哪怕投入再大、風(fēng)險(xiǎn)再高、周期再長，我們也要堅(jiān)決地做。生命科學(xué)沒有盡頭，只有盡力?！痹趦晌患钨e致辭結(jié)束后，大會正式進(jìn)入到主論壇演講環(huán)節(jié)，鄂維南、施一公、董晨、譚蔚泓四位中科院院士分別做了精彩分享。

作為主論壇報(bào)告的開場嘉賓，北京大數(shù)據(jù)研究院院長鄂維南，以《機(jī)器學(xué)習(xí)與科學(xué)計(jì)算》為題做了開場演講。鄂維南表示：“從50年代開始，科學(xué)計(jì)算領(lǐng)域發(fā)展了差分方法、有限元方法、譜方法等基本方法來處理基礎(chǔ)的物理模型，并且在工程和技術(shù)上得到了廣泛應(yīng)用。但依然還有很多問題沒有解決。例如：材料的性質(zhì)與設(shè)計(jì)；分子、藥物的性質(zhì)及設(shè)計(jì)；基于基本原理的控制論方法；燃燒問題（內(nèi)燃機(jī)的模擬、設(shè)計(jì)與控制）。這些因素也導(dǎo)致理論研究場景與實(shí)際問題距離甚遠(yuǎn)。

鄂維南認(rèn)為，解決這些問題的新的出路就是機(jī)器學(xué)習(xí)和物理模型的結(jié)合。以經(jīng)典的物理模型提供數(shù)據(jù)，在此基礎(chǔ)上通過機(jī)器學(xué)習(xí)產(chǎn)生更有效且同樣可靠的模型。以今天的生物計(jì)算為例，藥物設(shè)計(jì)最重要的環(huán)節(jié)之一就是自由能計(jì)算。如果沒有自由能計(jì)算，基于基本原理的設(shè)計(jì)藥物可能就是一句空話。

為此，鄂維南的團(tuán)隊(duì)用上述方法研發(fā)了高維空間的高效采樣和自由能計(jì)算的有效方案RiD。最后，鄂維南發(fā)表了自己對AI和科學(xué)計(jì)算的展望?！罢劦饺斯ぶ悄?，大家馬上想到的可能是自動駕駛、人臉識別等場景。但接下來，傳統(tǒng)的科學(xué)領(lǐng)域?qū)⒊蔀槿斯ぶ悄艿闹鲬?zhàn)場。AI for Science 將帶動生物、化學(xué)、材料、工程等領(lǐng)域進(jìn)入新的發(fā)展模式?！?/p>

大會的第二位分享嘉賓是中國科學(xué)院院士、美國國家科學(xué)院外籍院士、西湖大學(xué)校長施一公，他發(fā)表了演講《從生命科學(xué)的角度看AI》。在演講中，施一公主要從生物計(jì)算方法角度，分享了自己的觀點(diǎn)。施一公表示：“今天的生物計(jì)算大會，大家都在談新方法，我認(rèn)為世界所有方法理論，只有數(shù)學(xué)和物理，即使計(jì)算機(jī)也僅僅是數(shù)學(xué)的一種演繹。而生命科學(xué)是一個(gè)很大的領(lǐng)域，其中的任何一種新技術(shù)和方法，都可能帶來很大的變革潛力。”

以單克隆抗體為例，它在1975年出現(xiàn)的時(shí)候，僅僅是一種很單一的技術(shù)，但現(xiàn)在已經(jīng)創(chuàng)造出超千億美元的抗體藥市場。施一公認(rèn)為，“計(jì)算領(lǐng)域一次次的突破創(chuàng)新，會帶來人類對微觀世界認(rèn)知的革命，你要想抓住這次革命，就要和它同頻共振，用學(xué)術(shù)的眼光提前意識到做布局?！?/p>

第三位演講嘉賓是中國科學(xué)院院士、上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院教授、上海市免疫治療創(chuàng)新研究院創(chuàng)始院長董晨，他以《免疫治療創(chuàng)新—從基礎(chǔ)到臨床轉(zhuǎn)化》為題，對免疫治療中的AI創(chuàng)新做了介紹。 董晨表示：“免疫學(xué)是一個(gè)能夠上接天、下落地的全面學(xué)科，有非常多的理論，同時(shí)也是整個(gè)醫(yī)學(xué)領(lǐng)域里面發(fā)展最快的領(lǐng)域，這和人類各種疾病都密切相關(guān)?！币灾扑帪槔庖叻椒ê兔庖咝约膊≈委熢谏镏扑幍漠a(chǎn)業(yè)占比非常高——2019年全球銷售最好的十種藥里有五個(gè)都是免疫類藥物。

但現(xiàn)在的免疫檢查點(diǎn)治療都普遍存在兩個(gè)共性問題：免疫副作用較高和反應(yīng)率較低。以阻斷T細(xì)胞負(fù)調(diào)控分子提高免疫力手段為例：一方面可能導(dǎo)致病人出現(xiàn)腸炎、心肌炎、皮炎等多個(gè)副作用；另一方面，治療反應(yīng)率也比較低，同一種特效藥物可能對一部分患者有反應(yīng)，另一部分人則完全沒有效果。而AI和大數(shù)據(jù)可以提供很好的解決途徑：“隨著數(shù)據(jù)越來越多，標(biāo)簽化越來越細(xì)致，就可以幫助醫(yī)院做出更準(zhǔn)確的結(jié)論預(yù)測，幫臨床醫(yī)生將那些治療效果不好的腫瘤病人挑選出來，再選擇其他適合的免疫檢查點(diǎn)或靶點(diǎn)進(jìn)行藥物開發(fā)和治療。”

第四位演講嘉賓是中國科學(xué)院院士、發(fā)展中國家科學(xué)院院士、中國科學(xué)院腫瘤與基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所所長譚蔚泓，他以《基于AI的智能診斷以及多參數(shù)細(xì)胞、疾病分型》為題，做了演講。譚蔚泓表示， 生命科學(xué)由點(diǎn)及面，有海量的數(shù)據(jù)，同時(shí)人類的疾病復(fù)雜性、多樣性，要實(shí)現(xiàn)高效疾病診療，必須基于海量數(shù)據(jù)和多參數(shù)的表征。他提出，要利用高通量測量技術(shù)，結(jié)合多個(gè)識別疾病標(biāo)志物的分子探針，對病人樣本進(jìn)行多到300個(gè)疾病標(biāo)志物分子特征的甄別和定量測定；利用人工智能和大數(shù)據(jù)科學(xué)進(jìn)行解析，從而為疾病診斷提供精準(zhǔn)圖譜以判斷各種亞型的特征。接下來，譚蔚泓院士圍繞“分子計(jì)算”進(jìn)行了講解。

他提出了“分子大腦”的概念——人腦強(qiáng)于思維，電腦強(qiáng)于計(jì)算。但是電腦計(jì)算沒有太考慮分子層面的信息，而在分子層面的理解才是對事物最徹底的理解，尤其是在疾病或者生物領(lǐng)域里。分子計(jì)算，是將傳統(tǒng)方法里的“關(guān)鍵疾病分子信息提取”、“數(shù)據(jù)計(jì)算與分析”、“解讀報(bào)告”等進(jìn)行高效整合，像一個(gè)集成電路一樣進(jìn)行相關(guān)的分子識別，其優(yōu)勢就在于可以減少誤差，無需人工輔助就可以直接出報(bào)告。因此，分子大腦DNA邏輯回路就像是做一個(gè)多功能的“分子醫(yī)生”，將分子層面的識別與信息聯(lián)系起來，甚至還可以模擬人類的獲得性免疫系統(tǒng)。四位院士演講結(jié)束后，大會迎來了兩場深度的圓桌對話。

本場圓桌，由百圖生科聯(lián)合創(chuàng)始人&CEO劉維、恒瑞醫(yī)藥高級副總經(jīng)理兼全球研發(fā)負(fù)責(zé)人張連山、藥明康德聯(lián)席CEO楊青、佐治亞理工學(xué)院機(jī)器學(xué)習(xí)中心副主任宋樂、清華大學(xué)智慧產(chǎn)業(yè)研究院首席科學(xué)家馬維英等五位嘉賓共同參與。劉維的第一個(gè)問題是：藥企投入布局AI技術(shù)后，AI藥物發(fā)現(xiàn)公司還有哪些新機(jī)會？恒瑞醫(yī)藥張連山表示：“事實(shí)上，一款藥物從研發(fā)到生產(chǎn)（各個(gè)環(huán)節(jié)），市場都存在很多需求。恒瑞希望研發(fā)效率大大提高。但每一種藥并不是對每一個(gè)患者都有效，其中精準(zhǔn)分析和精準(zhǔn)診療都存在大量需求。如果AI技術(shù)可以實(shí)現(xiàn)治療的精準(zhǔn)化，就可以大大降低新藥研發(fā)成本，也讓患者的治療更加有效?！?/p>

張連山補(bǔ)充道，“即使是大藥廠，也有很多需求是他們無法滿足的。必須持開放心態(tài)來做這件事情，一個(gè)AI出來就能讓所有化學(xué)家失業(yè)？這肯定不是的。”

佐治亞理工學(xué)院宋樂則從學(xué)術(shù)的角度對這個(gè)問題進(jìn)行了闡述：“在醫(yī)藥行業(yè)，用AI來挖掘、探索靶點(diǎn)，或者是藥物設(shè)計(jì)問題，都需要多方參與?！倍?，AI新藥的真正作用，還需要和各種實(shí)驗(yàn)平臺形成閉環(huán)，這很像互聯(lián)網(wǎng)行業(yè)，用戶數(shù)據(jù)分散在各個(gè)社交、購物、咨詢、搜索平臺，只有把這些數(shù)據(jù)聚合在一起，形成數(shù)據(jù)和AI模型的閉環(huán)，才能讓更多人用AI系統(tǒng)來發(fā)現(xiàn)新藥物靶點(diǎn)?！标P(guān)于AI在生物計(jì)算和其他互聯(lián)網(wǎng)領(lǐng)域的應(yīng)用，清華大學(xué)馬維英也發(fā)表了自己的看法。他表示，2019年進(jìn)入新藥研發(fā)領(lǐng)域后才發(fā)現(xiàn)，相比其他領(lǐng)域的流程提升和優(yōu)化，AI在生命科學(xué)領(lǐng)域，未來十年真的會迎來蓬勃發(fā)展， “例如神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)逐漸發(fā)現(xiàn)新藥分子，三維結(jié)構(gòu)圖與圖模型在過去三年發(fā)展就非常快?！瘪R維英表示：不要在紅海繼續(xù)“擰毛巾”，視覺和自然語言理解還有很多事情可以做，將這些技術(shù)應(yīng)用在生命科學(xué)領(lǐng)域會有非常大的突破，可以解決醫(yī)藥、智慧醫(yī)療、個(gè)性化醫(yī)療等多個(gè)問題，這些還都是新的藍(lán)海市場?！?/p>

大會的第二場圓桌由薄荷天使基金創(chuàng)始合伙人劉毓文擔(dān)任主持，北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院長聘教授、百奧智匯張澤民，北京大學(xué)腫瘤醫(yī)院腫瘤生物信息中心主任吳健民，百圖生科副總裁、原吉利德生物信息和數(shù)據(jù)科學(xué)部執(zhí)行總監(jiān)蔣昭實(shí)等四位嘉賓參與了討論。在圓桌訪談中，薄荷天使劉毓文主要從AI在蛋白質(zhì)組、基因組等多組融合的應(yīng)用價(jià)值方面，向各位嘉賓進(jìn)行了發(fā)問。

北京大學(xué)張澤民首先從單細(xì)胞的研究方向上進(jìn)行了舉例，“單細(xì)胞研究經(jīng)常需要知道疾病最相關(guān)的細(xì)胞類型究竟是什么。以腫瘤為例，幾百種細(xì)胞類型里，和疾病相關(guān)的只有幾類。為了找到這幾類，可能需要對細(xì)胞類型有全面的了解，找到每一種細(xì)胞的分布情況，AI或許就能提供很直接的幫助，替代人工完成篩查，找到最特異和最有效的新型藥物?！?/p>

北京大學(xué)吳健民則從肝癌治療角度進(jìn)行了介紹。吳健民團(tuán)隊(duì)在應(yīng)對肝樣腺癌治療的時(shí)候，經(jīng)常會碰到轉(zhuǎn)移程度很快、但治療手段差的問題。通過對患者進(jìn)行多空間、多點(diǎn)取樣，以及近端淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移多組學(xué)的研究，和從基因組的亞克隆手段之后發(fā)現(xiàn)，這類病人里面都攜帶一些變異基因，根據(jù)這些基因?qū)ふ一颊咚幬锇悬c(diǎn)，就可以讓患者得到及時(shí)治療。AI可以在未來做更多類似的工作，來解決更多腫瘤患者無藥可治的情形。

百圖生科蔣昭實(shí)也表示：“多組學(xué)更廣義的問題就是能不能檢測多維度數(shù)據(jù)、這些數(shù)據(jù)能不能整合在一起。過去，蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)和基因組學(xué)數(shù)據(jù)很難交叉在一起。而AI可以對多位數(shù)據(jù)進(jìn)行共同分析。此外，不僅可以針對人類組學(xué)數(shù)據(jù)，還可以結(jié)合病原組學(xué)數(shù)據(jù)，這對新的靶點(diǎn)研究都有非常積極的影響?！?/p>

在上午的最后一個(gè)環(huán)節(jié)，大會發(fā)布了免疫圖譜卓越計(jì)劃并進(jìn)行聯(lián)盟簽約，百圖生科與維亞生物、和鉑醫(yī)藥等藥物研發(fā)領(lǐng)域的領(lǐng)軍企業(yè)；索智生物、宇道生物等AI藥物研發(fā)企業(yè)；深勢科技、燧坤智能等計(jì)算藥物設(shè)計(jì)平臺；百奧智匯、普瑞基準(zhǔn)等前沿組學(xué)企業(yè)；及Merck創(chuàng)新中心等大型跨國藥企在內(nèi)的30余家首批生態(tài)伙伴進(jìn)行了簽約。在這一生物計(jì)算生態(tài)計(jì)劃當(dāng)中，百圖生科將提供自身研發(fā)的核心生物計(jì)算引擎和自有數(shù)據(jù)、10億元的資金補(bǔ)貼，與生態(tài)聯(lián)盟合作伙伴共同助力免疫圖譜的繪制。

接下來，“免疫圖譜卓越計(jì)劃”將支持一批高質(zhì)量的轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究項(xiàng)目，聯(lián)合前沿生物技術(shù)專家、藥物開發(fā)專家和臨床專業(yè)團(tuán)隊(duì)，打造專業(yè)的“免疫圖譜”，系統(tǒng)探尋癌癥、自免、衰老等疾病的復(fù)雜免疫規(guī)律，為高效率的靶點(diǎn)挖掘和藥物設(shè)計(jì)提供可能。

原文標(biāo)題：首屆中國生物計(jì)算大會在蘇開幕：百位AI新藥產(chǎn)研先鋒，共謀行業(yè)新未來

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