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介紹一種業(yè)界受歡迎的分子克隆工具SnapGene

工程師鄧生 ? 來源:哲想軟件 ? 作者:哲想軟件 ? 2022-09-07 10:40 ? 次閱讀
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用簡單的方式來計劃、可視化和記錄您的日常分子克隆程序

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計劃

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提高準確性,同時加快進程,節(jié)約你的時間和金錢

優(yōu)雅、信息豐富的窗口,模擬常見克隆和PCR方法

清晰的示意圖,讓你清楚地看到不同構(gòu)造如何組合在一起

SnapGene通過持續(xù)跟蹤DNA甲基化和磷酸化等細節(jié),助你識別并規(guī)避常見失誤

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可視化

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憑借無與倫比的可視性和操控性,即使是克隆新手也能快速應(yīng)對復雜任務(wù)

獲得非凡的DNA及蛋白質(zhì)序列的可視結(jié)果

創(chuàng)建和瀏覽帶有豐富注釋的質(zhì)粒圖,或掃描帶有數(shù)千個注釋特性的大型DNA序列

通過高度可視化的測序結(jié)果與模擬結(jié)構(gòu)的比對,以確認克隆結(jié)果

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記錄

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模擬程序的自動化歸檔,助你節(jié)省更多時間,并讓分享和保存工作更輕松、更高效、也更有效

自動生成豐富的圖形歷史記錄,輕松查看序列編輯和克隆程序

通過共享包含歷史細節(jié)的完整結(jié)構(gòu),以增強協(xié)作、留存知識點

大膽嘗試全面的“撤銷”功能,追溯你的每一步

超越分子克隆的基礎(chǔ)知識

SnapGene成為最受歡迎的克隆工具是有依據(jù)的,它快速、智能、非常友好。

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直觀的技術(shù)可以識別克隆過程中的設(shè)計缺陷,從而糾正它們

使用您自己的引物模擬標準PCR,或允許SnapGene自動設(shè)計它們

專業(yè)的克隆工具確保所有主要分子克隆技術(shù)的快速準確構(gòu)建設(shè)計

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驗證您的項目設(shè)計并防止錯誤

自動查看質(zhì)粒的特征

既可以用SnapGene自有的特征數(shù)據(jù)庫,也可以用你的自定義特征在質(zhì)粒上注釋

在質(zhì)粒圖譜上或在序列視圖上詳細顯示酶切位點、特征、引物、ORFs,翻譯等信息

試試靈活注釋和可視化控件,自定義你的圖譜

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比對工具,方便檢查你的序列

功能強大的“比對參考(Alignto Reference)”工具,幫你驗證序列化結(jié)構(gòu)與模擬結(jié)構(gòu)是否匹配

使用可信賴的算法對序列進行成對/多重比對,涵蓋ClustalOmega,MAFFT,MUSCLE和T-Coffee

通過CAP3,將Sanger法測序加入完整的重疊群(contigs)

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逼真模擬瓊脂糖凝膠

憑借具有豐富經(jīng)驗的凝膠模擬算法,SnapGene能準確可視化你將在實驗室中看到的情景

靈活配置所有凝膠元素,包括多個(電泳)泳道,瓊脂糖%,運行時間以及全套MW標記

記錄并識別你感興趣的band,并提供每個(電泳)泳道的詳細片段信息

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可配置為自動記錄,數(shù)據(jù)交換非常輕松

自動創(chuàng)建圖形化歷史記錄

直觀地記錄實驗過程和文檔變更

在歷史記錄、圖譜、序列視圖中顯示歷史記錄顏色

嵌入在文檔中的完全可恢復的序列歷史

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轉(zhuǎn)換和共享你的數(shù)據(jù)

存儲、搜索、共享并組織你的序列、文件和圖譜

與存儲在可共享驅(qū)動器、服務(wù)器或云服務(wù)中的序列集合協(xié)同工作

輕松讀取和導出許多常用文件格式的序列、注釋和其他元數(shù)據(jù)

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產(chǎn)品特性

一起探索SnapGene的強大產(chǎn)品特性,增強你的日常分子克隆程序

分子克隆

限制性克隆

Gateway克隆

GibsonAssembly

NEBuilderHiFi組裝

In-Fusion克隆

TAand GC 克隆

TOPO克隆

引物

設(shè)計引物

退火兩個寡核苷酸以形成雙鏈產(chǎn)物

PCR和誘變

模擬PCR

重疊延伸PCR

引物定向誘變

酶組

酶組

預定義酶組– 按群或切位

創(chuàng)建自定義酶組

查看酶的詳細信息

對甲基化敏感性和相關(guān)錯誤預防提供多樣支持

轉(zhuǎn)換文件格式

AlignmentFormats

ApE

CLCBio

CloneManager

DNAStrider

DNADynamo

DNASIS

DNAssist

DNASTARLasergene

DSGene

EMBL(ENA)

EnzymeX

GenBank/ DDBJ

GeneConstruction Kit

Geneious

GeneTool

GenomeCompiler

Jellyfish

MacVector

pDRAW32

SerialCloner

Swiss-Prot

VectorNTI

VisualCloning

常規(guī)

跨平臺兼容性– Windows,macOS, Linux

翻譯

查看和編輯翻譯后功能

開放性閱讀框(ORFs)

完整序列翻譯

檢查基因融合框架

制作蛋白質(zhì)(從DNA)

反向翻譯(從蛋白質(zhì))

比對

將DNA序列與參考序列進行比對

驗證克隆或突變

將cDNA與染色體比對

成對和多序列DNA和蛋白質(zhì)比對

選擇比對算法-Clustal Omega, MAFFT, MUSCLE, T-Coffee

重疊群組裝

可視化

多個視圖下查看DNA序列

大序列支持– 瀏覽染色體大小序列

編輯DNA和蛋白質(zhì)序列

序列色碼

歷史記錄

全面“撤銷”功能

查看結(jié)果的圖形歷史

使用可選的歷史顏色來識別序列中最近的更改

瓊脂糖凝膠模擬

模擬瓊脂糖凝膠

模擬限制酶切消化

模擬聚合酶鏈式反應(yīng)擴增

大量收集MW標記

特性/注釋

創(chuàng)建和編輯特性

常見特性自動注釋

手動注釋異常特性

選擇其它密碼子

特性轉(zhuǎn)換的復雜編號

支持核糖體滑移

數(shù)據(jù)管理

從常用文件格式導入,包含注釋和說明

導出標準格式

創(chuàng)建和共享集合

通過SnapGeneViewer共享數(shù)據(jù)

運行批處理操作

安全文件管理

尋找DNA或蛋白質(zhì)序列

尋找酶、特性或引物



審核編輯:劉清

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原文標題:SnapGene:業(yè)界受歡迎的分子克隆工具

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