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基于數(shù)字微流控技術(shù)的上呼吸道易感病毒多靶標快速檢測方法

微流控 ? 來源:微流控 ? 2023-01-17 15:24 ? 次閱讀
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呼吸道病毒感染由于其高致病率及致死率,成為世界各國人民發(fā)病和死亡的主要原因之一。引起上呼吸道感染的病毒種類較多,尤其是甲型流感病毒新型H5N1(FluA-H5N1)、甲型流感病毒新型H1N1(FluA-H1N1)、乙型流感病毒(FluB)、冠狀病毒(SARS-CoV)、中東呼吸綜合征冠狀病毒(MERS-CoV)、新型冠狀病毒(2019-nCOV)等病毒在近一個世紀以來的多次大規(guī)模流行,給人類的生命健康和社會經(jīng)濟帶來巨大傷害。

這些上呼吸道感染的病毒引起的感染癥狀和季節(jié)性流行病毒特點相似,為避免造成群聚傳染,快速鑒別呼吸道病原體的檢測顯得尤為重要。

據(jù)麥姆斯咨詢報道,近期,拱北海關(guān)技術(shù)中心等科研機構(gòu)于《熱帶醫(yī)學雜志》發(fā)表研究性論文,將RT-qPCR技術(shù)和數(shù)字微流控技術(shù)相結(jié)合,建立一種基于數(shù)字微流控RT-qPCR芯片技術(shù)的上呼吸道易感病毒多靶標快速檢測方法。實現(xiàn)一種以少量樣品同時快速檢測多個呼吸道病原體的檢測技術(shù)。該方法滿足了目前市場對呼吸道病原體的高診斷率的需求,同時還為精準醫(yī)療提供了新的檢驗手段。

為實現(xiàn)一個芯片多個項目的檢測功能,研究人員將6個引物(2019-nCOV-N引物、2019-nCOV-Orf1引物、FluA-M1引物、FluB-HA引物、SARS-65引物、MERS-62引物)和相應(yīng)探針分別預(yù)存到芯片的各個反應(yīng)點中,并向反應(yīng)點添加引物預(yù)存液,而后將芯片置于風干干燥箱中干燥,接著將干燥好的芯片取出進行封裝處理。

芯片設(shè)置6個反應(yīng)點,從左往右依次是預(yù)存的2019-nCOV-N引物、2019-nCOV-Orf1引物、FluA-M1引物、FluB-HA引物、SARS-65引物和MERS-62引物

為了驗證該數(shù)字微流控RT-qPCR芯片的檢測性能,研究人員使用TE緩沖液將陽性質(zhì)粒10倍稀釋為10 pg/μL至0.01 fg/μL的濃度梯度,并根據(jù)RT-qPCR反應(yīng)體系和反應(yīng)程序,完成各單項目的引物、探針在AGS4800實時熒光定量PCR儀上的檢測下限檢測。

同樣,對相應(yīng)濃度的質(zhì)粒使用數(shù)字微流控芯片完成實時熒光RT-qPCR反應(yīng)。如圖2所示,6種引物在AGS4800實時熒光定量PCR儀上均可檢出對應(yīng)的陽性質(zhì)粒,對于10 pg/μL的質(zhì)粒均可在20個循環(huán)之前檢出,且45個循環(huán)內(nèi)無非特異性擴增。

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圖2 檢測試劑測試結(jié)果

此外,F(xiàn)luA、FluB、SARS-CoV、MERS-CoV、2019-nCOV這5個檢測項目使用PCR儀的25 μL體系最低可檢出0.01 fg/μL的質(zhì)粒,而數(shù)字微流控RT-qPCR芯片法每個反應(yīng)最低可檢出0.1 fg/μL的質(zhì)粒,與PCR儀2 μL體系靈敏度相同。根據(jù)公式,質(zhì)粒拷貝數(shù)濃度 =(質(zhì)粒濃度×摩爾系數(shù))/(質(zhì)粒長度×堿基對平均分子量),分別計算2種方法中的每個反應(yīng)的質(zhì)??截悢?shù)可得知,上述2種方法在2~25μL的體系下檢出限均為12~15拷貝/反應(yīng),檢測下限基本一致(圖3)。

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圖3 數(shù)字微流控RT-qPCR芯片的檢測下限測試結(jié)果

最后,為明確該數(shù)字微流控RT-qPCR芯片的檢測靈敏度和特異性,研究人員同時使用數(shù)字微流控RT-qPCR芯片和RT-qPCR儀檢測20個臨床標本(包含新冠病毒2例,甲型流感8例,乙型流感6例)的5項呼吸道病毒項目,共計100個測試反應(yīng),見表1。

結(jié)果顯示微流控芯片除樣品7出現(xiàn)一次對甲型流感病毒漏檢外,其余陽性樣品均檢出對應(yīng)病毒,對于20個樣品的5種病毒的總靈敏度為94%,總特異性為100%。Kappa值 = 0.962,兩個檢測方法具有高度一致,并且差異有統(tǒng)計學意義(P < 0.05)。

表1 PCR儀和微流控芯片檢測臨床樣本結(jié)果匯總

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綜上所述,該研究將多個RT-qPCR檢測項目與數(shù)字微流控檢測芯片結(jié)合,建立了在一次反應(yīng)中同時檢測多個項目的數(shù)字微流控RT-qPCR芯片。該數(shù)字微流控芯片RT-qPCR法可以以最少的樣本量快速檢測多個項目,自動化程度更高,可以提高上呼吸道病毒檢測的效率,提高應(yīng)對大規(guī)模疫情的快速反應(yīng)能力。





審核編輯:劉清

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原文標題:基于數(shù)字微流控技術(shù)的上呼吸道易感病毒多靶標快速檢測方法

文章出處:【微信號:Micro-Fluidics,微信公眾號:微流控】歡迎添加關(guān)注!文章轉(zhuǎn)載請注明出處。

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