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可實現(xiàn)較高效率的單分子檢測的數(shù)字膠體增強拉曼光譜

MEMS ? 來源:MEMS ? 2024-04-23 09:07 ? 次閱讀
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2024年4月17日,上海交通大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)院葉堅教授、邵志峰教授團隊在Nature期刊發(fā)表題為“Digital colloid-enhanced Raman spectroscopy by single-molecule counting”的研究論文,上海交通大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)院致遠榮譽計劃博士生畢心緣為論文第一作者,邵志峰教授、Daniel M. Czajkowsky教授為論文共同作者,葉堅教授為論文通訊作者。

該研究針對表面增強拉曼光譜領(lǐng)域內(nèi)定量的挑戰(zhàn),系統(tǒng)闡述了基于數(shù)字膠體增強拉曼光譜(dCERS)的定量技術(shù)?;趩畏肿佑嫈?shù),dCERS成功實現(xiàn)了超低濃度目標(biāo)分子的可靠定量檢測,為表面增強拉曼光譜技術(shù)的普遍應(yīng)用奠定了重要基礎(chǔ)。

研究團隊發(fā)明了數(shù)字膠體增強拉曼光譜(dCERS),利用膠體納米顆粒,可以實現(xiàn)較高效率的單分子檢測。雖然單分子信號強度波動巨大,這與過去的研究結(jié)果相吻合,但與常見的單分子表面增強拉曼光譜(SERS)技術(shù)不同的是,通過將光譜根據(jù)是否存在目標(biāo)分子拉曼特征峰進行0/1數(shù)字化,亦即陰性光譜和陽性光譜(數(shù)字信號),隨后對溶液中的陽性光譜進行計數(shù)。通過該單分子計數(shù)的方式可以實現(xiàn)對多種分子(如染料分子、代謝小分子、核酸、蛋白)的定量檢測,定量檢測限可以達到1fM以下(圖1)。其中,dCERS技術(shù)所采用的膠體顆粒的合成步驟簡單,易于放大生產(chǎn),在應(yīng)用中,可以方便地取出每個批次的少量顆粒來針對具體的目標(biāo)分子預(yù)先建立標(biāo)準(zhǔn)曲線,從而可以可靠地用于后續(xù)未知濃度樣本的定量。

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圖1. dCERS定量檢測原理與不同種類分子的定量標(biāo)準(zhǔn)曲線

在實驗中研究人員發(fā)現(xiàn),這些通過閾值確定的單分子事件,其出現(xiàn)次數(shù)的分布完全符合泊松統(tǒng)計,因此通過陽性光譜的數(shù)量,可以直接簡單地確定定量靈敏度與準(zhǔn)確性,這與傳統(tǒng)的基于模擬信號的定量方法完全不同。如圖2所示,通過增加檢測總光譜數(shù),可以累積陽性光譜數(shù)量,從而有效提升定量的準(zhǔn)確性,定量檢測誤差服從泊松噪聲。因此在真實應(yīng)用場景下,可以根據(jù)分子的檢出概率和對于準(zhǔn)確性、檢測總時長等的需求,通過累積陽性光譜數(shù)來調(diào)控定量檢測的準(zhǔn)確性,由此dCERS定量檢測具備精準(zhǔn)可控的可重復(fù)性。

研究發(fā)現(xiàn)還證明,針對不同的目標(biāo)分子,盡管濃度與單分子計數(shù)的依賴關(guān)系具有不同的系數(shù)(需要分別進行標(biāo)定),這些關(guān)系都符合吉布斯熱力學(xué)的理論。事實上,這是首次明確建立了單分子統(tǒng)計的物理基礎(chǔ),并可能適用于拉曼光譜之外的其它單分子計數(shù)技術(shù)。

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圖2. dCERS定量檢測誤差服從泊松分布

為了確立dCERS在實際測量中的潛力,研究團隊選取了百草枯和福美雙作為展示實例(圖3)。百草枯是一種高效、劇毒的除草劑,可以誘導(dǎo)帕金森氏病的發(fā)生,目前已有32個國家嚴格禁止其使用。福美雙是一種含硫劇毒殺真菌劑,被歐盟歸為二類致癌物。因此,超高靈敏度、準(zhǔn)確可靠的定量檢測技術(shù)對于這些分子的檢測非常重要,尤其是致癌物,原則上不存在安全劑量。

選取普通的湖水作為背景并混入微量的百草枯,研究團隊成功實現(xiàn)了低于歐盟最大殘留量規(guī)定三個數(shù)量級的檢測靈敏度。對于福美雙,研究團隊選取了實驗室培養(yǎng)的豆芽提取液,達到了優(yōu)于質(zhì)譜五個數(shù)量級的檢測靈敏度。并證明了,通過系列稀釋的方法,檢測中的背景干擾可以得到完美的抑制,從而實現(xiàn)準(zhǔn)確的靶分子濃度的測量。而dCERS的超高靈敏度和可靠的統(tǒng)計分布是實現(xiàn)這些定量測量的關(guān)鍵基礎(chǔ)。

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圖3. dCERS在微量分子檢測中的應(yīng)用

總之,該研究展示了dCERS技術(shù)基于單分子計數(shù)實現(xiàn)了超低濃度目標(biāo)分子在未知復(fù)雜背景中的可重復(fù)性定量,無需使用任何目標(biāo)分子的特定標(biāo)記。由于不同的目標(biāo)分子大多具有獨特的SERS光譜,dCERS可以實現(xiàn)多種不同分子的同時定量檢測,因此具有很好的應(yīng)用前景。另外,這項工作使用的膠體納米顆??梢苑奖愕剡M行大規(guī)模生產(chǎn)和制備,而檢測方法相對簡單,因此,dCERS有望進一步推動高靈敏檢測技術(shù)的變革和進步。


審核編輯:劉清
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原文標(biāo)題:基于單分子計數(shù)的數(shù)字膠體增強拉曼光譜

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